RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	CTF3	Q12748	733 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	CHS1	P08004	1131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	PMS1	P14242	873 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	MMS21	P38632	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	YHL026C	P38740	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	TVP23	P38962	199 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	SNZ3	P43545	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	ZAP1	P47043	880 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	SNZ2	P53824	298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	FMP30	Q02883	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	AIM41	Q12032	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	TAO3	P40468	2376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	JIP3	O13555	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	SFL1	P20134	766 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	MRP4	P32902	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	END3	P39013	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	GEM1	P39722	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	SDH1	Q00711	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	IVY1	Q04934	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	CDD1	Q06549	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	SDH5	Q08230	162 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	CIR2	Q08822	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	TRE1	Q08919	783 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRP3	YHR065C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	PUT4	P15380	627 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	VPS3	P23643	1011 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	VBA3	P25594	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
RRP3	YHR065C	GYP6	P32806	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SEG2	P34250	1132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	VBA5	P36172	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	POA1	P38218	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TMN3	P40071	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	DSE1	P40077	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ESL1	P40456	1118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RIM8	P53179	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	FRE1	P32791	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YKL077W	P36081	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	AGP2	P38090	596 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SEA4	P38164	1038 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	SHU2	P38957	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	CIN4	P39110	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MIC19	P43594	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	POL31	P46957	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	MON1	P53129	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	STP1	Q00947	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ARO80	Q04052	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	GYL1	Q04322	720 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	UFO1	Q04511	668 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	AIM39	Q08223	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	APC5	Q08683	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	GAL80	P04387	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TPK1	P06244	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRP3	YHR065C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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