RNA–Protein interactions for RNA: YHR015W

MIP6, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene MIP6, Length 1,980 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIP6	YHR015W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SPO22	P40511	975 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CIR1	P42940	261 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PKH1	Q03407	766 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	STP3	Q05937	343 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SKM1	Q12469	655 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YCK1	P23291	538 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ORC2	P32833	620 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SAF1	P38352	637 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	LYS9	P38999	446 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PES4	P39684	611 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YEL025C	P39991	1188 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	VFA1	P40080	203 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	NCS6	P53088	359 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PPN1	Q04119	674 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	AIM6	Q07716	390 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TGL5	Q12043	749 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	RTN2	Q12443	393 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	POM34	Q12445	299 aa		3.75	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YLR302C	O13544	120 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SOD2	P00447	233 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	GCN4	P03069	281 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ANP1	P32629	500 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YBR259W	P38338	688 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	RAD30	Q04049	632 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	VAM6	Q07468	1049 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YOR111W	Q99210	232 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	KAR3	P17119	729 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	MET12	P46151	657 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TEL2	P53038	688 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SPO1	P53541	631 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YNR061C	P53747	219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ZDS2	P54786	942 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ATG21	Q02887	496 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ROT1	Q03691	256 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	VPS64	Q03944	604 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SWM1	Q12379	170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ERG8	P24521	451 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SRO77	P38163	1010 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CAJ1	P39101	391 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ZAP1	P47043	880 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	COS12	P53053	380 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	MTL1	P53214	551 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	FCP1	Q03254	732 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	THI22	Q06490	572 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CTI6	Q08923	506 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CDC6	P09119	513 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PET122	P10355	254 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	KIN82	P25341	720 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	GEX2	P36173	615 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	RPP1	P38786	293 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ECM1	P39715	212 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YEL057C	P39983	233 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	not detected
MIP6	YHR015W	CTH1	P47976	325 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ARP9	Q05123	467 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	TMA16	Q08687	178 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	HUA2	Q12134	243 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	HIS5	P07172	385 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	DBF4	P32325	704 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	APT2	P36973	181 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CHA4	P43634	648 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	RCO1	Q04779	684 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	PEX19	Q07418	342 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	NMD4	Q12129	218 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	YLR122C	Q12312	125 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	VCX1	Q99385	411 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MIP6	YHR015W	CYB2	P00175	591 aa		3.71	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.2 ms