RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	VID28	P40547	921 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	YIR016W	P40572	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	MDV1	P47025	714 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	CYK3	Q07533	885 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
NEM1	YHR004C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	DGR2	P32330	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	ECM9	Q02202	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	HFI1	Q12060	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NEM1	YHR004C	DSS4	P32601	143 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	GRS2	Q06817	618 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	NDD1	Q08887	554 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	APM4	Q99186	491 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	CIR1	P42940	261 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	ATX2	Q12067	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	UBX3	Q12229	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	CDC26	P14724	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
NEM1	YHR004C	AEP2	P22136	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	DID4	P36108	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	FTH1	P38310	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	MNN1	P39106	762 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	LAS21	P40367	830 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	RAD33	Q04231	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	PCK1	P10963	549 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	CDC5	P32562	705 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	AAT1	Q01802	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	VTC3	Q02725	835 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	SCW10	Q04951	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	SCO2	P38072	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	FAT1	P38225	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	YTA7	P40340	1379 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	HLJ1	P48353	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NEM1	YHR004C	CBP3	P21560	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	MAK32	P23060	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	PEF1	P53238	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	DOS2	P54858	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	RTT107	P38850	1070 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	RAD26	P40352	1085 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	COG2	P53271	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	DSE3	Q08729	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	GDA1	P32621	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	SDH8	P38345	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	CIN1	P40987	1014 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	THI73	Q07904	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	MDR1	P53258	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	PHO2	P07269	559 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	MAM1	P40065	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	YGL260W	P53056	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	YNL092W	P53934	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	YIL152W	P40455	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	NRT1	Q08485	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NEM1	YHR004C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	YCR043C	P25361	127 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	CWH43	P25618	953 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	PLC1	P32383	869 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	ADR1	P07248	1323 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	HXT4	P32467	576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
NEM1	YHR004C	GAL4	P04386	881 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NEM1	YHR004C	PPG1	P32838	368 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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