RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W FUI1P38196 639 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W APD1P38281 316 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YHR020WP38708 688 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W DOT6P40059 670 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W FMP10P40098 244 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ARG2P40360 574 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W BAP3P41815 604 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VTC2P43585 828 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W URB2P47108 1174 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TRF5P48561 642 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W CTR1P49573 406 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TAD1P53065 400 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ORM1P53224 222 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data3.62□□□□□ -1.83not detected
VFA1YER128W TAF8Q03750 510 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SEG1Q04279 960 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GAD1Q04792 585 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SVF1Q05515 481 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W CRN1Q06440 651 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YLR352WQ06479 807 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YDL144CQ07589 356 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.62□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SIR3P06701 978 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VPS1P21576 704 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VPS34P22543 875 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YCL002CP25565 263 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W POL4P25615 582 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MSH1P25846 959 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W BMH1P29311 267 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SEC66P33754 206 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YKL063CP35725 167 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RRN3P36070 627 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SET3P36124 751 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PIH1P38768 344 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RRF1P38771 230 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SPT8P38915 602 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W CCT3P39077 534 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VAC8P39968 578 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YJL070CP40361 888 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MNT3P40549 630 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RET2P43621 546 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MDV1P47025 714 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SCS3P53012 380 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MPS2P53159 387 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HST1P53685 503 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PLP1Q04004 230 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PDR18P53756 1333 aa3.61□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PDR10P51533 1564 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YML002WP0CF17 737 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PGI1P12709 554 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YAP1P19880 650 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PWP1P21304 576 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RPC53P25441 422 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YJU2P28320 278 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HSP104P31539 908 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TPS2P31688 896 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VPH2P32341 215 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PPG1P32838 368 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W UBC6P33296 250 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W STO1P34160 861 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YKR018CP36114 725 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VPS51P36116 164 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YSW1P38280 609 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YBR242WP38331 238 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SET5P38890 526 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YHB1P39676 399 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RSM25P40496 264 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SYG1P40528 902 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SNZ3P43545 298 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W APS3P47064 194 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YJR142WP47173 342 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W UTP8P53276 713 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HOL1P53389 586 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SNZ2P53824 298 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TEX1P53851 422 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W FYV6P53913 173 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W OPY2Q06810 360 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SYO1Q07395 620 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W FMP25Q08023 583 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.6□□□□□ -1.83not detected
VFA1YER128W THI21Q08975 551 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TRM8Q12009 286 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MED4Q12343 284 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GPR1Q12361 961 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W OSH2Q12451 1283 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HBN1Q96VH4 193 aa3.6□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GAL1P04385 528 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W HIS3P06633 220 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MEI4P29467 408 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W NTG1P31378 399 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MGM1P32266 881 aa3.59□□□□□ -1.83
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