RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 NAPBQ9H115 298 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.19■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 TMC6Q7Z403 805 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 JMYQ8N9B5 988 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA5Q8NB90 893 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0G2JS52 829 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 SNAP23O00161 211 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MBD4O95243 580 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 FAM193AP78312 1265 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 NBPF11Q86T75 865 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 TOMM22Q9NS69 142 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ATRNO75882 1429 aa15.18■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 SLC5A1P13866 664 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MAP3K12Q12852 859 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 CREBRFQ8IUR6 639 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ARMT1Q9H993 441 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 LY9Q9HBG7 655 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 C4AP0C0L4 1744 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 C4BP0C0L5 1744 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 CLCN6P51797 869 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 CLIC6Q96NY7 704 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.17■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 PPP6R2O75170 966 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 SHC4Q6S5L8 630 aa15.16■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 FGFR2P21802 821 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 PLA2G4AP47712 749 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 RASGRF1Q13972 1273 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ALX1Q15699 326 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 NTRK3Q16288 839 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 NEK11Q8NG66 645 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MYH3P11055 1940 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 EXOC5O00471 708 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 TDO2P48775 406 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 PNOCQ13519 176 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 PTPAQ15257 358 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 RGS22Q8NE09 1264 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TMOD1-202ENST00000375175 ITGB4P16144 1822 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 BCL9O00512 1426 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 PRKAB2O43741 272 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 NCAPHQ15003 741 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 ABCA3Q99758 1704 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 LIFRP42702 1097 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 FANCCQ00597 558 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 SUSD4Q5VX71 490 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC150Q8NCX0 1101 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 MAP3K14Q99558 947 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 HPSEQ9Y251 543 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.14■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.13■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 CERS3Q8IU89 383 aa15.13■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.13■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 KRT23Q9C075 422 aa15.13■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 TSPYL1Q9H0U9 437 aa15.13■□□□□ 0.01
TMOD1-202ENST00000375175 NUP98P52948 1817 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms