RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vcam1P29533 739 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cbx2P30658 519 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pagr1aQ99L02 253 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MsraQ9D6Y7 233 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam205a1D3YZF6 1314 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mmp10O55123 476 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcm2P97310 904 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncf1Q09014 390 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Otud5Q3U2S4 566 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mum1l1Q4VA55 681 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gimap3Q99MI6 301 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cfap99A0A140LIX9 648 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Frmd7A2AD83 703 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CrcpO35427 148 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hmox1P14901 289 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kansl1lQ5DTI6 991 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pramel6Q810Y9 485 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Appbp2Q9DAX9 585 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam178bQ24JP3 464 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mansc4Q3UU94 337 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cnksr2Q80YA9 1032 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lca5lQ8C0X0 741 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pold4Q9CWP8 107 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stk3Q9JI10 497 aa27.34■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa27.34■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Plcg1Q62077 1302 aa27.34■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp953Q3UPV7 304 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pde3bQ61409 1100 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx11Q6AXC6 880 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Senp6Q6P7W0 1132 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rfc4Q99J62 364 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Btbd19S4R1I0 287 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2d9P11714 504 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nbr1P97432 988 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppm1gQ61074 542 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cetn4Q8K4K1 168 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn1r199Q8R280 367 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pus3Q9JI38 481 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Add2Q9QYB8 725 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prss40A6H6T1 365 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc4a4O88343 1079 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CsadQ9DBE0 493 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mkrn1Q9QXP6 481 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam186bD3Z420 943 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zkscan2G3X952 960 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acsl1P41216 699 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpsm2Q8VDU0 679 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atl3Q91YH5 541 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ak7Q9D2H2 614 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myh2G3UW82 1942 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CtshP49935 333 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Garem2Q6PAJ3 880 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KhnynQ80U38 671 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adgra2Q91ZV8 1336 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc24Q8BHA1 521 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syne4Q8CII8 388 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2d10P24456 504 aa27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PpatQ8CIH9 517 aa27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bmp2kQ91Z96 1138 aa27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dicer1Q8R418 1916 aa27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gnat2P50149 354 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sv2cQ69ZS6 727 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tjap1Q9DCD5 539 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm44503E9PYU5 387 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oog1E9Q5G7 496 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r68L7N2B3 851 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bnip3O55003 187 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtpraP18052 829 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnaaf4Q8R368 420 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il7P10168 154 aa27.24■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arl14Q3SXC5 192 aa27.24■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ehmt1Q5DW34 1296 aa27.24■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam196bQ6GQV1 535 aa27.24■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nudt12Q9DCN1 462 aa27.24■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acot3Q9QYR7 432 aa27.24■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Frmpd4A2AFR3 1320 aa27.23■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sema3eP70275 775 aa27.23■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 VrtnQ3SYK4 740 aa27.23■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MlphQ91V27 590 aa27.23■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RragcQ99K70 398 aa27.23■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col2a1P28481 1487 aa27.22■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lmbrd2Q8C561 694 aa27.22■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa27.22■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp33Q8R5K2 909 aa27.22■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rbm43Q99J64 343 aa27.22■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Brca1P48754 1812 aa27.21■■□□□ 1.95
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Has3O08650 554 aa27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.2 ms