Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD5

Tjap1, Tight junction-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjap1Q9DCD5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,48■■■■■ 4,87
Tjap1Q9DCD5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Tjap1Q9DCD5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,39■■■■■ 4,22
Tjap1Q9DCD5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,62■■■■□ 3,93
Tjap1Q9DCD5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,54■■■■□ 3,92
Tjap1Q9DCD5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC38,83■■■■□ 3,81
Tjap1Q9DCD5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
Tjap1Q9DCD5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Tjap1Q9DCD5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Tjap1Q9DCD5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,04■■■■□ 3,68
Tjap1Q9DCD5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Tjap1Q9DCD5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37,88■■■■□ 3,65
Tjap1Q9DCD5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Tjap1Q9DCD5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,43■■■■□ 3,58
Tjap1Q9DCD5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Tjap1Q9DCD5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36,83■■■■□ 3,49
Tjap1Q9DCD5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Tjap1Q9DCD5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,62■■■■□ 3,45
Tjap1Q9DCD5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,57■■■■□ 3,45
Tjap1Q9DCD5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,54■■■■□ 3,44
Tjap1Q9DCD5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Tjap1Q9DCD5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Tjap1Q9DCD5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,36■■■■□ 3,41
Tjap1Q9DCD5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Tjap1Q9DCD5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Tjap1Q9DCD5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Tjap1Q9DCD5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Tjap1Q9DCD5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Tjap1Q9DCD5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Tjap1Q9DCD5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
Tjap1Q9DCD5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
Tjap1Q9DCD5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Tjap1Q9DCD5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Tjap1Q9DCD5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Tjap1Q9DCD5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Tjap1Q9DCD5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Tjap1Q9DCD5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Tjap1Q9DCD5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Tjap1Q9DCD5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Tjap1Q9DCD5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34,95■■■■□ 3,19
Tjap1Q9DCD5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Tjap1Q9DCD5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Tjap1Q9DCD5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,79■■■■□ 3,16
Tjap1Q9DCD5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,74■■■■□ 3,15
Tjap1Q9DCD5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,74■■■■□ 3,15
Tjap1Q9DCD5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34,73■■■■□ 3,15
Tjap1Q9DCD5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Tjap1Q9DCD5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Tjap1Q9DCD5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,56■■■■□ 3,12
Tjap1Q9DCD5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
Tjap1Q9DCD5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,36■■■■□ 3,09
Tjap1Q9DCD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Tjap1Q9DCD5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Tjap1Q9DCD5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Tjap1Q9DCD5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
Tjap1Q9DCD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Tjap1Q9DCD5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Tjap1Q9DCD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Tjap1Q9DCD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,11■■■■□ 3,05
Tjap1Q9DCD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3,03
Tjap1Q9DCD5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Tjap1Q9DCD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
Tjap1Q9DCD5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Tjap1Q9DCD5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Tjap1Q9DCD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33,84■■■■□ 3,01
Tjap1Q9DCD5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Tjap1Q9DCD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Tjap1Q9DCD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,83■■■■□ 3,01
Tjap1Q9DCD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Tjap1Q9DCD5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Tjap1Q9DCD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Tjap1Q9DCD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,71■■■□□ 2,99
Tjap1Q9DCD5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Tjap1Q9DCD5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Tjap1Q9DCD5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Tjap1Q9DCD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Tjap1Q9DCD5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Tjap1Q9DCD5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,53■■■□□ 2,96
Tjap1Q9DCD5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,51■■■□□ 2,95
Tjap1Q9DCD5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Tjap1Q9DCD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Tjap1Q9DCD5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,94
Tjap1Q9DCD5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,43■■■□□ 2,94
Tjap1Q9DCD5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Tjap1Q9DCD5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,41■■■□□ 2,94
Tjap1Q9DCD5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Tjap1Q9DCD5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Tjap1Q9DCD5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Tjap1Q9DCD5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Tjap1Q9DCD5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Tjap1Q9DCD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,35■■■□□ 2,93
Tjap1Q9DCD5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Tjap1Q9DCD5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Tjap1Q9DCD5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Tjap1Q9DCD5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,24■■■□□ 2,91
Tjap1Q9DCD5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Tjap1Q9DCD5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,16■■■□□ 2,9
Tjap1Q9DCD5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,11■■■□□ 2,89
Tjap1Q9DCD5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
Tjap1Q9DCD5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms