RNA–Protein interactions for RNA: YMR019W

STB4, Transcript of Putative transcription factor, yeast

Gene STB4, Length 2,850 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB4	YMR019W	AIM7	Q12156	149 aa		3.66	□□□□□ -1.82
STB4	YMR019W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	KIN1	P13185	1064 aa		3.65	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	SAM3	Q08986	587 aa		3.65	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	RAD54	P32863	898 aa		3.63	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	VHR2	P40041	505 aa		3.63	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	GLC3	P32775	704 aa		3.63	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	DMA2	P53924	522 aa		3.63	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	MST1	P07236	462 aa		3.62	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	MSB4	Q12317	492 aa		3.62	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	HTA2	P04912	132 aa		3.62	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	YGR273C	P53329	174 aa		3.61	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	DCW1	P36091	449 aa		3.61	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	YOL036W	Q08206	761 aa		3.6	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	DIT2	P21595	489 aa		3.59	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	RLF2	Q12495	606 aa		3.59	□□□□□ -1.83
STB4	YMR019W	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	SET4	P42948	560 aa		3.59	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	UBP9	P39967	754 aa		3.58	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	KEX1	P09620	729 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	CLB5	P30283	435 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	WSC3	Q12215	556 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	BRL1	P38770	471 aa		3.57	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	AI4	P03878	556 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	PEX21	P50091	288 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	HPC2	Q01448	625 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	YDR090C	Q03193	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	MPH3	P0CE00	602 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	TEA1	P47988	759 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	JIP4	Q03361	876 aa		3.55	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
STB4	YMR019W	YEL023C	P39992	682 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	CSC1	Q06538	782 aa		3.54	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	PTC4	P38089	393 aa		3.53	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	YMR196W	Q04336	1088 aa		3.53	□□□□□ -1.84
STB4	YMR019W	CSN12	P47130	423 aa		3.53	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	ULI1	P43604	169 aa		3.52	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	SPP1	Q03012	353 aa		3.52	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	SOL3	P38858	249 aa		3.52	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	DAN4	P47179	1161 aa		3.52	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	TFB4	Q12004	338 aa		3.51	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	ORC6	P38826	435 aa		3.51	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	PEX29	Q03370	554 aa		3.51	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	VNX1	P42839	908 aa		3.49	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	RGR1	P19263	1082 aa		3.49	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	TFB3	Q03290	321 aa		3.49	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		3.49	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	SLI15	P38283	698 aa		3.48	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	YPR109W	Q06104	294 aa		3.48	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	NST1	P53935	1240 aa		3.47	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	DPL1	Q05567	589 aa		3.47	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	SEC61	P32915	480 aa		3.46	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	YBL036C	P38197	257 aa		3.46	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	MMP1	Q12372	583 aa		3.46	□□□□□ -1.85
STB4	YMR019W	NPL4	P33755	580 aa		3.46	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	RTG1	P32607	177 aa		3.45	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	HST2	P53686	357 aa		3.45	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	PML39	Q03760	334 aa		3.45	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	CDC73	Q06697	393 aa		3.45	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	ISU2	Q12056	156 aa		3.45	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	CSE4	P36012	229 aa		3.44	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	FPK1	P53739	893 aa		3.44	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	YJL007C	P47080	104 aa		3.44	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	RTF1	P53064	558 aa		3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	YRR1	Q12172	810 aa		3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	NCR1	Q12200	1170 aa		3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	LDB19	Q12502	818 aa		3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	NIS1	P53939	407 aa		3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	YDL129W	Q07555	291 aa		3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	IOC2	Q12072	812 aa		3.43	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	ARG8	P18544	423 aa		3.42	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	LAM6	Q08001	693 aa		3.42	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	TBF1	Q02457	562 aa		3.42	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	MPC54	Q08550	464 aa		3.42	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	YNL115C	P53925	644 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	SLY41	P22215	453 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	NMA111	P53920	997 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	RAD59	Q12223	238 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	SIT4	P20604	311 aa		3.41	□□□□□ -1.86
STB4	YMR019W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86

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