RNA–Protein interactions for RNA: YKR079C

TRZ1, Transcript of tRNA 3'-end processing endonuclease tRNase Z, yeast

Gene TRZ1, Length 2,517 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRZ1	YKR079C	GTT3	P39996	337 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	MST1	P07236	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	VHR2	P40041	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	DIT2	P21595	489 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	GYP5	Q12344	894 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	KIC1	P38692	1080 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	YGR273C	P53329	174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	YDR090C	Q03193	310 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	ATF2	P53296	535 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	RAD54	P32863	898 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TRZ1	YKR079C	RLF2	Q12495	606 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	YOL036W	Q08206	761 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	KEX1	P09620	729 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	MSB4	Q12317	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	HTA2	P04912	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	DCW1	P36091	449 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	SOL3	P38858	249 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	RIP-Chip
TRZ1	YKR079C	HPC2	Q01448	625 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	SET4	P42948	560 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	AI4	P03878	556 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	NST1	P53935	1240 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TRZ1	YKR079C	MPH3	P0CE00	602 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	ORC6	P38826	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	CLB5	P30283	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	BRL1	P38770	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	TEA1	P47988	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	YEL023C	P39992	682 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	TFB3	Q03290	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	WSC3	Q12215	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	CSN12	P47130	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	CSC1	Q06538	782 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRZ1	YKR079C	RGR1	P19263	1082 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	DAN4	P47179	1161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	SLI15	P38283	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	JIP4	Q03361	876 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	PTC4	P38089	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	TFB4	Q12004	338 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	VNX1	P42839	908 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	ULI1	P43604	169 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	PEX21	P50091	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	HST2	P53686	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	YPR109W	Q06104	294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TRZ1	YKR079C	PKC1	P24583	1151 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	CDC73	Q06697	393 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	FPK1	P53739	893 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	NIS1	P53939	407 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	UBP9	P39967	754 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	SPP1	Q03012	353 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	MMP1	Q12372	583 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	YBL036C	P38197	257 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	DPL1	Q05567	589 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	SIT4	P20604	311 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	BIM1	P40013	344 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	YJL007C	P47080	104 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	IOC2	Q12072	812 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	MPC54	Q08550	464 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	CSE4	P36012	229 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	PEX29	Q03370	554 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	RAD59	Q12223	238 aa		4.48	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	SEC61	P32915	480 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	PML39	Q03760	334 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	ESS1	P22696	170 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	ATG32	P40458	529 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	RTF1	P53064	558 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	ISU2	Q12056	156 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TRZ1	YKR079C	RTG1	P32607	177 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	MID1	P41821	548 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	YRR1	Q12172	810 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	BIO2	P32451	375 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	LAM6	Q08001	693 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	LDB19	Q12502	818 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TRZ1	YKR079C	SCJ1	P25303	377 aa		4.44	□□□□□ -1.7

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