RNA–Protein interactions for RNA: YKL133C

YKL133C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL133C, Length 1,392 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL133CYKL133C RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
YKL133CYKL133C PAN1P32521 1480 aa12.28□□□□□ -0.44
YKL133CYKL133C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data12.28□□□□□ -0.44not detected
YKL133CYKL133C SNT2P53127 1403 aa12.27□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-ER2Q03619 1755 aa12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-MR1Q04214 1755 aa12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-NL1Q12112 1755 aa12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-GR1Q12141 1755 aa12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C TY1B-BLQ12490 1755 aa12.23□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C CDC25P04821 1589 aa12.22□□□□□ -0.45
YKL133CYKL133C YBT1P32386 1661 aa12.17□□□□□ -0.46
YKL133CYKL133C VPS15P22219 1454 aa12.17□□□□□ -0.46
YKL133CYKL133C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
YKL133CYKL133C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
YKL133CYKL133C IRC20Q06554 1556 aa12.12□□□□□ -0.47
YKL133CYKL133C POL5P39985 1022 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
YKL133CYKL133C NOP2P40991 618 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
YKL133CYKL133C CAT8P39113 1433 aa12.09□□□□□ -0.47
YKL133CYKL133C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
YKL133CYKL133C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C RTT106P40161 455 aa12.05□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C DNF1P32660 1571 aa12.05□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C NTE1Q04958 1679 aa12.03□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
YKL133CYKL133C ENP1P38333 483 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
YKL133CYKL133C SRB8P25648 1427 aa11.98□□□□□ -0.49
YKL133CYKL133C PDR10P51533 1564 aa11.98□□□□□ -0.49
YKL133CYKL133C GDB1Q06625 1536 aa11.96□□□□□ -0.49
YKL133CYKL133C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
YKL133CYKL133C GCN2P15442 1659 aa11.95□□□□□ -0.5
YKL133CYKL133C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
YKL133CYKL133C NUP159P40477 1460 aa11.92□□□□□ -0.5
YKL133CYKL133C PDR12Q02785 1511 aa11.88□□□□□ -0.51
YKL133CYKL133C SPT7P35177 1332 aa11.88□□□□□ -0.51
YKL133CYKL133C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C SPO14P36126 1683 aa11.82□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C CKB1P43639 278 aa11.82□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C MET10P39692 1035 aa11.81□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C MMS1Q06211 1407 aa11.79□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C YRF1-1P0CX20 1796 aa11.78□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C YRF1-5P0CX21 1796 aa11.78□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C YRF1-8P0CX22 1796 aa11.78□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C IQG1Q12280 1495 aa11.77□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C YSP2Q06681 1438 aa11.77□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C BUD3P25558 1636 aa11.77□□□□□ -0.52
YKL133CYKL133C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
YKL133CYKL133C NOP7P53261 605 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
YKL133CYKL133C MHP1P43638 1398 aa11.69□□□□□ -0.54
YKL133CYKL133C PRS1P32895 427 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
YKL133CYKL133C YOR093CQ12275 1648 aa11.67□□□□□ -0.54
YKL133CYKL133C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
YKL133CYKL133C PAF1P38351 445 aa11.64□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C MET5P47169 1442 aa11.62□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C LTE1P07866 1435 aa11.62□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
YKL133CYKL133C BNR1P40450 1375 aa11.57□□□□□ -0.56
YKL133CYKL133C AVT3P36062 692 aa11.56□□□□□ -0.56
YKL133CYKL133C RAV1P47104 1357 aa11.56□□□□□ -0.56
YKL133CYKL133C LEU3P08638 886 aa11.55□□□□□ -0.56
YKL133CYKL133C ORC1P54784 914 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
YKL133CYKL133C RTC1Q08281 1341 aa11.54□□□□□ -0.56
YKL133CYKL133C PDR11P40550 1411 aa11.52□□□□□ -0.57
YKL133CYKL133C MRPL32P25348 183 aa11.5□□□□□ -0.57
YKL133CYKL133C PDS5Q04264 1277 aa11.48□□□□□ -0.57
YKL133CYKL133C VMR1P38735 1592 aa11.47□□□□□ -0.57
YKL133CYKL133C DRS2P39524 1355 aa11.44□□□□□ -0.58
YKL133CYKL133C TAF5P38129 798 aa11.42□□□□□ -0.58
YKL133CYKL133C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
YKL133CYKL133C NUP192P47054 1683 aa11.41□□□□□ -0.58
YKL133CYKL133C ESL2P36168 1195 aa11.41□□□□□ -0.58
YKL133CYKL133C KIP3P53086 805 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C DOP1Q03921 1698 aa11.39□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C IML1P47170 1584 aa11.39□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C TFA1P36100 482 aa11.39□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C NST1P53935 1240 aa11.39□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C TRM3Q07527 1436 aa11.35□□□□□ -0.59
YKL133CYKL133C SCT1P32784 759 aa11.33□□□□□ -0.6
YKL133CYKL133C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
YKL133CYKL133C REB1P21538 810 aa11.29□□□□□ -0.6
YKL133CYKL133C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
YKL133CYKL133C SPE2P21182 396 aa11.28□□□□□ -0.6
YKL133CYKL133C DNF2Q12675 1612 aa11.28□□□□□ -0.6
YKL133CYKL133C RPP0P05317 312 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
YKL133CYKL133C IOC4Q04213 475 aa11.25□□□□□ -0.61
YKL133CYKL133C VPS27P40343 622 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
YKL133CYKL133C CDC45Q08032 650 aa11.23□□□□□ -0.61
YKL133CYKL133C YAP3P38749 330 aa11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12 ms