RNA–Protein interactions for RNA: YJR069C

HAM1, Transcript of Nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, yeastyeast

Gene HAM1, Length 594 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAM1YJR069C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C STH1P32597 1359 aa11.27□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-ER2Q03619 1755 aa11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-MR1Q04214 1755 aa11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-NL1Q12112 1755 aa11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-GR1Q12141 1755 aa11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TY1B-BLQ12490 1755 aa11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TSC11P40061 1430 aa11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TRM732Q03496 1420 aa11.26□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C TAF7Q05021 590 aa11.25□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C MRPL32P25348 183 aa11.24□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
HAM1YJR069C NUP170P38181 1502 aa11.2□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C SNT2P53127 1403 aa11.19□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C RIM101P33400 625 aa11.19□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C YCK3P39962 524 aa11.17□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C NTE1Q04958 1679 aa11.17□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C DNF1P32660 1571 aa11.16□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HAM1YJR069C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HAM1YJR069C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
HAM1YJR069C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
HAM1YJR069C TY3B-GQ99315 1547 aa11.11□□□□□ -0.63
HAM1YJR069C IRC20Q06554 1556 aa11.09□□□□□ -0.63
HAM1YJR069C YBT1P32386 1661 aa11.06□□□□□ -0.64
HAM1YJR069C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HAM1YJR069C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
HAM1YJR069C IFH1P39520 1085 aa11□□□□□ -0.65
HAM1YJR069C NUP159P40477 1460 aa10.99□□□□□ -0.65
HAM1YJR069C CAT8P39113 1433 aa10.97□□□□□ -0.65
HAM1YJR069C SSM4P40318 1319 aa10.96□□□□□ -0.65
HAM1YJR069C YRF1-1P0CX20 1796 aa10.95□□□□□ -0.66
HAM1YJR069C YRF1-5P0CX21 1796 aa10.95□□□□□ -0.66
HAM1YJR069C YRF1-8P0CX22 1796 aa10.95□□□□□ -0.66
HAM1YJR069C PDR12Q02785 1511 aa10.94□□□□□ -0.66
HAM1YJR069C VPS15P22219 1454 aa10.94□□□□□ -0.66
HAM1YJR069C MET5P47169 1442 aa10.92□□□□□ -0.66
HAM1YJR069C SPO14P36126 1683 aa10.9□□□□□ -0.66
HAM1YJR069C GDB1Q06625 1536 aa10.89□□□□□ -0.67
HAM1YJR069C RTT106P40161 455 aa10.88□□□□□ -0.67
HAM1YJR069C PDR10P51533 1564 aa10.88□□□□□ -0.67
HAM1YJR069C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
HAM1YJR069C OXP1P28273 1286 aa10.82□□□□□ -0.68
HAM1YJR069C CDC27P38042 758 aa10.81□□□□□ -0.68
HAM1YJR069C TFC8Q12308 588 aa10.81□□□□□ -0.68
HAM1YJR069C SRB8P25648 1427 aa10.79□□□□□ -0.68
HAM1YJR069C HOP09932 586 aa10.78□□□□□ -0.68
HAM1YJR069C MET10P39692 1035 aa10.78□□□□□ -0.68
HAM1YJR069C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
HAM1YJR069C GCN2P15442 1659 aa10.73□□□□□ -0.69
HAM1YJR069C IQG1Q12280 1495 aa10.71□□□□□ -0.69
HAM1YJR069C YSP2Q06681 1438 aa10.7□□□□□ -0.7
HAM1YJR069C PTP3P40048 928 aa10.7□□□□□ -0.7
HAM1YJR069C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
HAM1YJR069C BUD3P25558 1636 aa10.69□□□□□ -0.7
HAM1YJR069C DCD1P06773 312 aa10.69□□□□□ -0.7
HAM1YJR069C MMS1Q06211 1407 aa10.67□□□□□ -0.7
HAM1YJR069C SSP1P38871 571 aa10.64□□□□□ -0.71
HAM1YJR069C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
HAM1YJR069C LTE1P07866 1435 aa10.63□□□□□ -0.71
HAM1YJR069C CKB1P43639 278 aa10.62□□□□□ -0.71
HAM1YJR069C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
HAM1YJR069C DOP1Q03921 1698 aa10.6□□□□□ -0.71
HAM1YJR069C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
HAM1YJR069C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
HAM1YJR069C YOR093CQ12275 1648 aa10.58□□□□□ -0.72
HAM1YJR069C TRM3Q07527 1436 aa10.57□□□□□ -0.72
HAM1YJR069C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
HAM1YJR069C RSM7P47150 247 aa10.53□□□□□ -0.72
HAM1YJR069C BNR1P40450 1375 aa10.52□□□□□ -0.72
HAM1YJR069C YGL015CP33199 130 aa10.52□□□□□ -0.73
HAM1YJR069C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.51□□□□□ -0.73not detected
HAM1YJR069C YLR271WQ06152 274 aa10.5□□□□□ -0.73
HAM1YJR069C BCH2P36122 765 aa10.48□□□□□ -0.73
HAM1YJR069C DRS2P39524 1355 aa10.47□□□□□ -0.73
HAM1YJR069C BNI1P41832 1953 aa10.46□□□□□ -0.73
HAM1YJR069C VMR1P38735 1592 aa10.46□□□□□ -0.74
HAM1YJR069C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
HAM1YJR069C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
HAM1YJR069C DNF2Q12675 1612 aa10.4□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C POL5P39985 1022 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C NOP7P53261 605 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C IML1P47170 1584 aa10.38□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C PDR11P40550 1411 aa10.37□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C RAV1P47104 1357 aa10.36□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C AI2P03876 854 aa10.35□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C SCY1P53009 804 aa10.34□□□□□ -0.75
HAM1YJR069C PAF1P38351 445 aa10.33□□□□□ -0.76
HAM1YJR069C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
HAM1YJR069C BBC1P47068 1157 aa10.32□□□□□ -0.76
HAM1YJR069C ITT1Q04638 464 aa10.32□□□□□ -0.76
HAM1YJR069C EPS1P40557 701 aa10.3□□□□□ -0.76
HAM1YJR069C RTC1Q08281 1341 aa10.3□□□□□ -0.76
HAM1YJR069C NUP192P47054 1683 aa10.29□□□□□ -0.76
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