RNA–Protein interactions for RNA: YHR132C

ECM14, Transcript of Putative metalloprotease with similarity to zinc carboxypeptidases, yeastyeast

Gene ECM14, Length 1,293 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM14YHR132C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C TY1B-ER2Q03619 1755 aa9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C TY1B-MR1Q04214 1755 aa9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C TY1B-NL1Q12112 1755 aa9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C TY1B-GR1Q12141 1755 aa9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C TY1B-BLQ12490 1755 aa9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C DNF1P32660 1571 aa9.8□□□□□ -0.84
ECM14YHR132C SPP41P38904 1435 aa9.76□□□□□ -0.85
ECM14YHR132C NTE1Q04958 1679 aa9.74□□□□□ -0.85
ECM14YHR132C VTH1P40438 1549 aa9.73□□□□□ -0.85
ECM14YHR132C VTH2P40890 1549 aa9.73□□□□□ -0.85
ECM14YHR132C MLP2P40457 1679 aa9.71□□□□□ -0.85
ECM14YHR132C SPT21P35209 758 aa9.71□□□□□ -0.86
ECM14YHR132C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
ECM14YHR132C TSC11P40061 1430 aa9.69□□□□□ -0.86
ECM14YHR132C TRM732Q03496 1420 aa9.66□□□□□ -0.86
ECM14YHR132C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
ECM14YHR132C CDC27P38042 758 aa9.65□□□□□ -0.86
ECM14YHR132C MET5P47169 1442 aa9.65□□□□□ -0.87
ECM14YHR132C ULS1Q08562 1619 aa9.63□□□□□ -0.87
ECM14YHR132C YRF1-1P0CX20 1796 aa9.63□□□□□ -0.87
ECM14YHR132C YRF1-5P0CX21 1796 aa9.63□□□□□ -0.87
ECM14YHR132C YRF1-8P0CX22 1796 aa9.63□□□□□ -0.87
ECM14YHR132C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
ECM14YHR132C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
ECM14YHR132C NUP159P40477 1460 aa9.58□□□□□ -0.88
ECM14YHR132C DMA1P38823 416 aa9.57□□□□□ -0.88
ECM14YHR132C SNT2P53127 1403 aa9.56□□□□□ -0.88
ECM14YHR132C STH1P32597 1359 aa9.54□□□□□ -0.88
ECM14YHR132C IRC20Q06554 1556 aa9.5□□□□□ -0.89
ECM14YHR132C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ECM14YHR132C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ECM14YHR132C VPS15P22219 1454 aa9.47□□□□□ -0.89
ECM14YHR132C SPO14P36126 1683 aa9.47□□□□□ -0.89
ECM14YHR132C LTE1P07866 1435 aa9.45□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C YBT1P32386 1661 aa9.45□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C PDR12Q02785 1511 aa9.44□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C HOP09932 586 aa9.41□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C GDB1Q06625 1536 aa9.41□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C TY3B-GQ99315 1547 aa9.41□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C TFC8Q12308 588 aa9.4□□□□□ -0.9
ECM14YHR132C DCD1P06773 312 aa9.39□□□□□ -0.91
ECM14YHR132C BNI1P41832 1953 aa9.37□□□□□ -0.91
ECM14YHR132C RIM101P33400 625 aa9.34□□□□□ -0.91
ECM14YHR132C RTT106P40161 455 aa9.34□□□□□ -0.91
ECM14YHR132C NUP170P38181 1502 aa9.34□□□□□ -0.91
ECM14YHR132C PDR10P51533 1564 aa9.33□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C CAT8P39113 1433 aa9.32□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C IFH1P39520 1085 aa9.31□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C MET10P39692 1035 aa9.31□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C DOP1Q03921 1698 aa9.29□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ECM14YHR132C IQG1Q12280 1495 aa9.27□□□□□ -0.93
ECM14YHR132C BUD3P25558 1636 aa9.27□□□□□ -0.93
ECM14YHR132C DRS2P39524 1355 aa9.25□□□□□ -0.93
ECM14YHR132C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
ECM14YHR132C LEO1P38439 464 aa9.23□□□□□ -0.93
ECM14YHR132C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
ECM14YHR132C TRM3Q07527 1436 aa9.21□□□□□ -0.94
ECM14YHR132C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
ECM14YHR132C ITT1Q04638 464 aa9.17□□□□□ -0.94
ECM14YHR132C DNF2Q12675 1612 aa9.16□□□□□ -0.94
ECM14YHR132C PTP3P40048 928 aa9.15□□□□□ -0.94
ECM14YHR132C SRB8P25648 1427 aa9.14□□□□□ -0.95
ECM14YHR132C MMS1Q06211 1407 aa9.14□□□□□ -0.95
ECM14YHR132C YSP2Q06681 1438 aa9.14□□□□□ -0.95
ECM14YHR132C SCY1P53009 804 aa9.13□□□□□ -0.95
ECM14YHR132C BCH2P36122 765 aa9.1□□□□□ -0.95
ECM14YHR132C CKB1P43639 278 aa9.07□□□□□ -0.96
ECM14YHR132C SSM4P40318 1319 aa9.06□□□□□ -0.96
ECM14YHR132C OXP1P28273 1286 aa9.06□□□□□ -0.96
ECM14YHR132C GCN2P15442 1659 aa9.04□□□□□ -0.96
ECM14YHR132C BNR1P40450 1375 aa9.03□□□□□ -0.96
ECM14YHR132C YOR093CQ12275 1648 aa9.03□□□□□ -0.96
ECM14YHR132C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ECM14YHR132C SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ECM14YHR132C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
ECM14YHR132C VMR1P38735 1592 aa8.96□□□□□ -0.97
ECM14YHR132C DNF3Q12674 1656 aa8.95□□□□□ -0.98
ECM14YHR132C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ECM14YHR132C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ECM14YHR132C TGL3P40308 642 aa8.91□□□□□ -0.98
ECM14YHR132C IML1P47170 1584 aa8.88□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C EPS1P40557 701 aa8.86□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C SSP1P38871 571 aa8.85□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C UBP9P39967 754 aa8.85□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C HAP1P0CE41 1502 aa8.85□□□□□ -0.99
ECM14YHR132C BDF1P35817 686 aa8.82□□□□□ -1
ECM14YHR132C LEU3P08638 886 aa8.8□□□□□ -1
ECM14YHR132C YAP3P38749 330 aa8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.6 ms