RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640586.1

HADH-222, Transcript of hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, human

TSL 5

Gene HADH, Length 3,308 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HADH-222	ENST00000640586	HMGXB3	Q12766	1538 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HADH-222	ENST00000640586	CFTR	P13569	1480 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HADH-222	ENST00000640586	IGF1R	P08069	1367 aa		13.77	□□□□□ -0.2
HADH-222	ENST00000640586	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.77	□□□□□ -0.2
HADH-222	ENST00000640586	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	FKBP8	Q14318	412 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	NEFL	P07196	543 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HADH-222	ENST00000640586	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HADH-222	ENST00000640586	ANP32C	O43423	234 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HADH-222	ENST00000640586	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HADH-222	ENST00000640586	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HADH-222	ENST00000640586	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HADH-222	ENST00000640586	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HADH-222	ENST00000640586	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HADH-222	ENST00000640586	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HADH-222	ENST00000640586	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HADH-222	ENST00000640586	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HADH-222	ENST00000640586	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HADH-222	ENST00000640586	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HADH-222	ENST00000640586	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HADH-222	ENST00000640586	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.57	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.53	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
HADH-222	ENST00000640586	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.52	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	PRDM2	Q13029	1718 aa		13.51	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.49	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	NES	P48681	1621 aa		13.48	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	TOPBP1	Q92547	1522 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HADH-222	ENST00000640586	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.46	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	13.41	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	FOXD1	Q16676	465 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	NAIP	Q13075	1403 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HADH-222	ENST00000640586	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	CUL7	Q14999	1698 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HADH-222	ENST00000640586	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	GRIN2B	Q13224	1484 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	MSH5	O43196	834 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.27	□□□□□ -0.28
HADH-222	ENST00000640586	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	SAMD9	Q5K651	1589 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.26	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		13.25	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.24	□□□□□ -0.29
HADH-222	ENST00000640586	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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