RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRT-211ENST00000618610 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRT-211ENST00000618610 IL27Q8NEV9 243 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRT-211ENST00000618610 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 PRDM2Q13029 1718 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 FANCIQ9NVI1 1328 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRT-211ENST00000618610 SYNJ1O43426 1573 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRT-211ENST00000618610 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRT-211ENST00000618610 KCNA4P22459 653 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRT-211ENST00000618610 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-211ENST00000618610 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.47□□□□□ -0.57
PTPRT-211ENST00000618610 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRT-211ENST00000618610 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 NESP48681 1621 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 KIF21BO75037 1637 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 CFTRP13569 1480 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRT-211ENST00000618610 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 CADPSQ9ULU8 1353 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 FBLN2P98095 1184 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 CUX2O14529 1486 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRT-211ENST00000618610 ANP32CO43423 234 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 WDR62O43379 1518 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 KIF27Q86VH2 1401 aa11.32□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 ARAP1Q96P48 1450 aa11.31□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 TOP2BQ02880 1626 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.3□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 PRXQ9BXM0 1461 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.29□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.28□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
PTPRT-211ENST00000618610 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.27□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 FOXD1Q16676 465 aa11.26□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 ERCC6Q03468 1493 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.25□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 CUX1P39880 1505 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.24□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 CCER2I3L3R5 266 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 NEFMP07197 916 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.22□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PTPRT-211ENST00000618610 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.21□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 WDR97A6NE52 1622 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 IGF1RP08069 1367 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC184Q52MB2 194 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 PLEKHG5O94827 1062 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRT-211ENST00000618610 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRT-211ENST00000618610 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-211ENST00000618610 TOPBP1Q92547 1522 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRT-211ENST00000618610 FGD5Q6ZNL6 1462 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRT-211ENST00000618610 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRT-211ENST00000618610 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 ADRA2BP18089 450 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 TONSLQ96HA7 1378 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 MAPKBP1O60336 1514 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 TIAM1Q13009 1591 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 SLC4A3P48751 1232 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
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