RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615553.1

C18orf25-204, Transcript of chromosome 18 open reading frame 25, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene C18orf25, Length 2,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf25-204ENST00000615553 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.87■■■□□ 2.21
C18orf25-204ENST00000615553 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.86■■■□□ 2.21
C18orf25-204ENST00000615553 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.86■■■□□ 2.21
C18orf25-204ENST00000615553 MAPKBP1O60336 1514 aa28.84■■■□□ 2.21
C18orf25-204ENST00000615553 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.21
C18orf25-204ENST00000615553 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.84■■■□□ 2.218e-7■■■■■ 28.7
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C18orf25-204ENST00000615553 MYT1Q01538 1121 aa28.82■■■□□ 2.2
C18orf25-204ENST00000615553 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.82■■■□□ 2.2
C18orf25-204ENST00000615553 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.82■■■□□ 2.2
C18orf25-204ENST00000615553 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.81■■■□□ 2.2
C18orf25-204ENST00000615553 ITGAEP38570 1179 aa28.8■■■□□ 2.2
C18orf25-204ENST00000615553 CUL7Q14999 1698 aa28.78■■■□□ 2.2
C18orf25-204ENST00000615553 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
C18orf25-204ENST00000615553 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.76■■■□□ 2.19
C18orf25-204ENST00000615553 TOPBP1Q92547 1522 aa28.72■■■□□ 2.19
C18orf25-204ENST00000615553 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
C18orf25-204ENST00000615553 FMN1Q68DA7 1419 aa28.68■■■□□ 2.18
C18orf25-204ENST00000615553 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
C18orf25-204ENST00000615553 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.64■■■□□ 2.18
C18orf25-204ENST00000615553 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.64■■■□□ 2.18
C18orf25-204ENST00000615553 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.62■■■□□ 2.17
C18orf25-204ENST00000615553 P3H3Q8IVL6 736 aa28.55■■■□□ 2.16
C18orf25-204ENST00000615553 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.54■■■□□ 2.16
C18orf25-204ENST00000615553 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.52■■■□□ 2.16
C18orf25-204ENST00000615553 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
C18orf25-204ENST00000615553 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.51■■■□□ 2.15
C18orf25-204ENST00000615553 WDR97A6NE52 1622 aa28.51■■■□□ 2.15
C18orf25-204ENST00000615553 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
C18orf25-204ENST00000615553 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
C18orf25-204ENST00000615553 SAMD9Q5K651 1589 aa28.46■■■□□ 2.15
C18orf25-204ENST00000615553 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.45■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.44■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.43■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 HFM1A2PYH4 1435 aa28.43■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 NESP48681 1621 aa28.42■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 UACAQ9BZF9 1416 aa28.39■■■□□ 2.14
C18orf25-204ENST00000615553 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.37■■■□□ 2.13
C18orf25-204ENST00000615553 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.36■■■□□ 2.13
C18orf25-204ENST00000615553 GRIN2BQ13224 1484 aa28.36■■■□□ 2.13
C18orf25-204ENST00000615553 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.36■■■□□ 2.13
C18orf25-204ENST00000615553 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.35■■■□□ 2.13
C18orf25-204ENST00000615553 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.33■■■□□ 2.13
C18orf25-204ENST00000615553 CCER2I3L3R5 266 aa28.33■■■□□ 2.13
C18orf25-204ENST00000615553 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
C18orf25-204ENST00000615553 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.32■■■□□ 2.12
C18orf25-204ENST00000615553 NCOA2Q15596 1464 aa28.31■■■□□ 2.12
C18orf25-204ENST00000615553 TONSLQ96HA7 1378 aa28.31■■■□□ 2.12
C18orf25-204ENST00000615553 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
C18orf25-204ENST00000615553 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.29■■■□□ 2.12
C18orf25-204ENST00000615553 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
C18orf25-204ENST00000615553 NAIPQ13075 1403 aa28.25■■■□□ 2.11
C18orf25-204ENST00000615553 ARHGEF11O15085 1522 aa28.24■■■□□ 2.11
C18orf25-204ENST00000615553 PTPRKQ15262 1439 aa28.24■■■□□ 2.11
C18orf25-204ENST00000615553 ANP32CO43423 234 aa28.22■■■□□ 2.11
C18orf25-204ENST00000615553 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.22■■■□□ 2.11
C18orf25-204ENST00000615553 KCNH8Q96L42 1107 aa28.21■■■□□ 2.11
C18orf25-204ENST00000615553 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.19■■■□□ 2.1
C18orf25-204ENST00000615553 AKNAQ7Z591 1439 aa28.18■■■□□ 2.1
C18orf25-204ENST00000615553 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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C18orf25-204ENST00000615553 HECW1Q76N89 1606 aa28.12■■■□□ 2.09
C18orf25-204ENST00000615553 MIA2Q96PC5 1412 aa28.09■■■□□ 2.09
C18orf25-204ENST00000615553 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.05■■■□□ 2.08
C18orf25-204ENST00000615553 IQGAP2Q13576 1575 aa28.03■■■□□ 2.08
C18orf25-204ENST00000615553 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.03■■■□□ 2.08
C18orf25-204ENST00000615553 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.02■■■□□ 2.08
C18orf25-204ENST00000615553 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
C18orf25-204ENST00000615553 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28■■■□□ 2.07
C18orf25-204ENST00000615553 NEFLP07196 543 aa28■■■□□ 2.07
C18orf25-204ENST00000615553 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
C18orf25-204ENST00000615553 PBRM1Q86U86 1689 aa27.97■■■□□ 2.07
C18orf25-204ENST00000615553 ADAMTS12P58397 1594 aa27.95■■■□□ 2.06
C18orf25-204ENST00000615553 FKBP8Q14318 412 aa27.94■■■□□ 2.06
C18orf25-204ENST00000615553 WDR62O43379 1518 aa27.91■■■□□ 2.06
C18orf25-204ENST00000615553 ROCK1Q13464 1354 aa27.89■■■□□ 2.06
C18orf25-204ENST00000615553 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.89■■■□□ 2.05
C18orf25-204ENST00000615553 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
C18orf25-204ENST00000615553 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.84■■■□□ 2.05
C18orf25-204ENST00000615553 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
C18orf25-204ENST00000615553 TRIM52Q96A61 297 aa27.84■■■□□ 2.05
C18orf25-204ENST00000615553 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.83■■■□□ 2.05
C18orf25-204ENST00000615553 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.81■■■□□ 2.04
C18orf25-204ENST00000615553 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
C18orf25-204ENST00000615553 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
C18orf25-204ENST00000615553 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.78■■■□□ 2.04
C18orf25-204ENST00000615553 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.77■■■□□ 2.04
C18orf25-204ENST00000615553 IFT140Q96RY7 1462 aa27.76■■■□□ 2.04
C18orf25-204ENST00000615553 DAPK1P53355 1430 aa27.76■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 KDM6BO15054 1643 aa27.74■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 BCANQ96GW7 911 aa27.74■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.72■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.71■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 KIAA0556O60303 1618 aa27.71■■■□□ 2.03
C18orf25-204ENST00000615553 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.69■■■□□ 2.02
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