RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612143.1

AL139384.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AL139384.1, Length 3,047 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL139384.1-201ENST00000612143 MSH5O43196 834 aa24.57■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 P3H3Q8IVL6 736 aa24.57■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 BCANQ96GW7 911 aa24.56■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.55■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.54■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.54■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.53■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.53■■□□□ 1.52
AL139384.1-201ENST00000612143 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.44■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.44■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 ARAP1Q96P48 1450 aa24.43■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
AL139384.1-201ENST00000612143 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.37■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.33■■□□□ 1.49
AL139384.1-201ENST00000612143 FKBP8Q14318 412 aa24.32■■□□□ 1.48
AL139384.1-201ENST00000612143 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
AL139384.1-201ENST00000612143 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.29■■□□□ 1.48
AL139384.1-201ENST00000612143 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.26■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.25■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.25■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 ERCC6Q03468 1493 aa24.24■■□□□ 1.47
AL139384.1-201ENST00000612143 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.19■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 ITGAEP38570 1179 aa24.19■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.18■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.18■■□□□ 1.46
AL139384.1-201ENST00000612143 WDR97A6NE52 1622 aa24.14■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.11■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.11■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 ARID3CA6NKF2 412 aa24.1■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 FBLN2P98095 1184 aa24.08■■□□□ 1.45
AL139384.1-201ENST00000612143 KCNH8Q96L42 1107 aa24.06■■□□□ 1.44
AL139384.1-201ENST00000612143 NEFLP07196 543 aa24■■□□□ 1.43
AL139384.1-201ENST00000612143 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
AL139384.1-201ENST00000612143 CUL7Q14999 1698 aa24■■□□□ 1.43
AL139384.1-201ENST00000612143 WDR62O43379 1518 aa23.95■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 PBRM1Q86U86 1689 aa23.91■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 IFT140Q96RY7 1462 aa23.9■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 IL27Q8NEV9 243 aa23.89■■□□□ 1.42
AL139384.1-201ENST00000612143 GRIN2BQ13224 1484 aa23.89■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.89■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.88■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.87■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 NBR1Q14596 966 aa23.85■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.83■■□□□ 1.41
AL139384.1-201ENST00000612143 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 TIAM1Q13009 1591 aa23.82■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 ADAMTS12P58397 1594 aa23.81■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.79■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.77■■□□□ 1.4
AL139384.1-201ENST00000612143 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 SLC24A1O60721 1099 aa23.75■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.73■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.72■■□□□ 1.39
AL139384.1-201ENST00000612143 FMN1Q68DA7 1419 aa23.7■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 IQGAP2Q13576 1575 aa23.69■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.68■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 SAMD9Q5K651 1589 aa23.68■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 GRIN2AQ12879 1464 aa23.67■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 PKNOX2Q96KN3 472 aa23.67■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.67■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
AL139384.1-201ENST00000612143 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.63■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 TRIM52Q96A61 297 aa23.62■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.58■■□□□ 1.37
AL139384.1-201ENST00000612143 JPH4Q96JJ6 628 aa23.57■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 CEP170Q5SW79 1584 aa23.56■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 MAP3K1Q13233 1512 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 SYNJ2O15056 1496 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 DISP1Q96F81 1524 aa23.55■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
AL139384.1-201ENST00000612143 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.51■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.51■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 NCOA2Q15596 1464 aa23.48■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.47■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.46■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
AL139384.1-201ENST00000612143 KIAA0556O60303 1618 aa23.44■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.43■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 PTPRKQ15262 1439 aa23.42■■□□□ 1.34
AL139384.1-201ENST00000612143 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms