RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PDE4C-211ENST00000597360 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.46■■□□□ 1.03
PDE4C-211ENST00000597360 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PDE4C-211ENST00000597360 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.44■■□□□ 1.02
PDE4C-211ENST00000597360 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4C-211ENST00000597360 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4C-211ENST00000597360 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PDE4C-211ENST00000597360 NESP48681 1621 aa21.43■■□□□ 1.02
PDE4C-211ENST00000597360 GOLGA3Q08378 1498 aa21.4■■□□□ 1.02
PDE4C-211ENST00000597360 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PDE4C-211ENST00000597360 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
PDE4C-211ENST00000597360 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
PDE4C-211ENST00000597360 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 SYNJ1O43426 1573 aa21.32■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 IL27Q8NEV9 243 aa21.29■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 PRDM2Q13029 1718 aa21.28■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.28■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.28■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
PDE4C-211ENST00000597360 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.25■□□□□ 0.99
PDE4C-211ENST00000597360 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.25■□□□□ 0.99
PDE4C-211ENST00000597360 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.25■□□□□ 0.99
PDE4C-211ENST00000597360 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.24■□□□□ 0.99
PDE4C-211ENST00000597360 CUX1P39880 1505 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4C-211ENST00000597360 CCER2I3L3R5 266 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4C-211ENST00000597360 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PDE4C-211ENST00000597360 EEA1Q15075 1411 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4C-211ENST00000597360 TOP2BQ02880 1626 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4C-211ENST00000597360 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4C-211ENST00000597360 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4C-211ENST00000597360 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PDE4C-211ENST00000597360 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.12■□□□□ 0.97
PDE4C-211ENST00000597360 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4C-211ENST00000597360 NEFMP07197 916 aa21.07■□□□□ 0.96
PDE4C-211ENST00000597360 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.07■□□□□ 0.96
PDE4C-211ENST00000597360 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.07■□□□□ 0.96
PDE4C-211ENST00000597360 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.06■□□□□ 0.96
PDE4C-211ENST00000597360 MRS2Q9HD23 443 aa21.04■□□□□ 0.96
PDE4C-211ENST00000597360 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4C-211ENST00000597360 TONSLQ96HA7 1378 aa21.03■□□□□ 0.96
PDE4C-211ENST00000597360 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PDE4C-211ENST00000597360 TOPBP1Q92547 1522 aa21■□□□□ 0.95
PDE4C-211ENST00000597360 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
PDE4C-211ENST00000597360 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4C-211ENST00000597360 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.98■□□□□ 0.95
PDE4C-211ENST00000597360 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.96■□□□□ 0.95
PDE4C-211ENST00000597360 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PDE4C-211ENST00000597360 P3H3Q8IVL6 736 aa20.94■□□□□ 0.94
PDE4C-211ENST00000597360 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
PDE4C-211ENST00000597360 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.9■□□□□ 0.94
PDE4C-211ENST00000597360 WDR97A6NE52 1622 aa20.89■□□□□ 0.93
PDE4C-211ENST00000597360 ERCC6Q03468 1493 aa20.89■□□□□ 0.93
PDE4C-211ENST00000597360 CCDC184Q52MB2 194 aa20.87■□□□□ 0.93
PDE4C-211ENST00000597360 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.87■□□□□ 0.93
PDE4C-211ENST00000597360 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4C-211ENST00000597360 CUX2O14529 1486 aa20.84■□□□□ 0.93
PDE4C-211ENST00000597360 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.84■□□□□ 0.93
PDE4C-211ENST00000597360 KIF27Q86VH2 1401 aa20.83■□□□□ 0.92
PDE4C-211ENST00000597360 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4C-211ENST00000597360 KIF21BO75037 1637 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4C-211ENST00000597360 ARXQ96QS3 562 aa20.76■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.75■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.75■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 WDR62O43379 1518 aa20.74■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 IGF1RP08069 1367 aa20.72■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PDE4C-211ENST00000597360 SLC4A3P48751 1232 aa20.7■□□□□ 0.9
PDE4C-211ENST00000597360 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PDE4C-211ENST00000597360 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
PDE4C-211ENST00000597360 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PDE4C-211ENST00000597360 PRXQ9BXM0 1461 aa20.67■□□□□ 0.9
PDE4C-211ENST00000597360 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
PDE4C-211ENST00000597360 AKNAQ7Z591 1439 aa20.63■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 MAPKBP1O60336 1514 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.62■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 GSE1Q14687 1217 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.893e-6■■■■□ 24.7
PDE4C-211ENST00000597360 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 PDE4AP27815 886 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4C-211ENST00000597360 ARAP1Q96P48 1450 aa20.58■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 IFT140Q96RY7 1462 aa20.57■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 TMC1Q8TDI8 760 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 USP35Q9P2H5 1018 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 NUDCQ9Y266 331 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.55■□□□□ 0.88
PDE4C-211ENST00000597360 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms