RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597360.5

PDE4C-211, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4C, Length 3,511 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-211ENST00000597360 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.3■■■□□ 2.28
PDE4C-211ENST00000597360 HRCP23327 699 aa25.85■■□□□ 1.73
PDE4C-211ENST00000597360 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.76■■□□□ 1.71
PDE4C-211ENST00000597360 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PDE4C-211ENST00000597360 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PDE4C-211ENST00000597360 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.58■■□□□ 1.69
PDE4C-211ENST00000597360 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.48■■□□□ 1.67
PDE4C-211ENST00000597360 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PDE4C-211ENST00000597360 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.72■■□□□ 1.55
PDE4C-211ENST00000597360 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PDE4C-211ENST00000597360 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.6■■□□□ 1.53
PDE4C-211ENST00000597360 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
PDE4C-211ENST00000597360 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.56■■□□□ 1.52
PDE4C-211ENST00000597360 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.48■■□□□ 1.51
PDE4C-211ENST00000597360 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PDE4C-211ENST00000597360 ABCC9O60706 1549 aa24.42■■□□□ 1.5
PDE4C-211ENST00000597360 MYT1Q01538 1121 aa24.4■■□□□ 1.5
PDE4C-211ENST00000597360 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.36■■□□□ 1.49
PDE4C-211ENST00000597360 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PDE4C-211ENST00000597360 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.14■■□□□ 1.45
PDE4C-211ENST00000597360 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.11■■□□□ 1.45
PDE4C-211ENST00000597360 NEUROD1Q13562 356 aa24.05■■□□□ 1.44
PDE4C-211ENST00000597360 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PDE4C-211ENST00000597360 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PDE4C-211ENST00000597360 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PDE4C-211ENST00000597360 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PDE4C-211ENST00000597360 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PDE4C-211ENST00000597360 NACADO15069 1562 aa23.8■■□□□ 1.4
PDE4C-211ENST00000597360 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PDE4C-211ENST00000597360 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PDE4C-211ENST00000597360 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PDE4C-211ENST00000597360 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.64■■□□□ 1.37
PDE4C-211ENST00000597360 SCRIBQ14160 1630 aa23.58■■□□□ 1.37
PDE4C-211ENST00000597360 TRIM41Q8WV44 630 aa23.53■■□□□ 1.36
PDE4C-211ENST00000597360 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.22■■□□□ 1.31
PDE4C-211ENST00000597360 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
PDE4C-211ENST00000597360 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PDE4C-211ENST00000597360 BCL11AQ9H165 835 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE4C-211ENST00000597360 MIER1Q8N108 512 aa23.02■■□□□ 1.27
PDE4C-211ENST00000597360 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.01■■□□□ 1.27
PDE4C-211ENST00000597360 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.89■■□□□ 1.25
PDE4C-211ENST00000597360 BCANQ96GW7 911 aa22.83■■□□□ 1.25
PDE4C-211ENST00000597360 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.82■■□□□ 1.24
PDE4C-211ENST00000597360 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PDE4C-211ENST00000597360 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PDE4C-211ENST00000597360 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE4C-211ENST00000597360 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.69■■□□□ 1.22
PDE4C-211ENST00000597360 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PDE4C-211ENST00000597360 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PDE4C-211ENST00000597360 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.58■■□□□ 1.21
PDE4C-211ENST00000597360 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PDE4C-211ENST00000597360 SMARCA4P51532 1647 aa22.53■■□□□ 1.2
PDE4C-211ENST00000597360 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.51■■□□□ 1.19
PDE4C-211ENST00000597360 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PDE4C-211ENST00000597360 WIZO95785 1651 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4C-211ENST00000597360 NEFLP07196 543 aa22.37■■□□□ 1.17
PDE4C-211ENST00000597360 FKBP8Q14318 412 aa22.37■■□□□ 1.17
PDE4C-211ENST00000597360 APLP2Q06481 763 aa22.36■■□□□ 1.17
PDE4C-211ENST00000597360 ITGAEP38570 1179 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4C-211ENST00000597360 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PDE4C-211ENST00000597360 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PDE4C-211ENST00000597360 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.24■■□□□ 1.15
PDE4C-211ENST00000597360 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.23■■□□□ 1.15
PDE4C-211ENST00000597360 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.21■■□□□ 1.15
PDE4C-211ENST00000597360 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PDE4C-211ENST00000597360 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PDE4C-211ENST00000597360 SMARCA2P51531 1590 aa22.13■■□□□ 1.13
PDE4C-211ENST00000597360 KCNH8Q96L42 1107 aa22.11■■□□□ 1.13
PDE4C-211ENST00000597360 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PDE4C-211ENST00000597360 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.04■■□□□ 1.12
PDE4C-211ENST00000597360 TRIM52Q96A61 297 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4C-211ENST00000597360 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.03■■□□□ 1.12
PDE4C-211ENST00000597360 NCAPD3P42695 1498 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4C-211ENST00000597360 CEP162Q5TB80 1403 aa22.02■■□□□ 1.12
PDE4C-211ENST00000597360 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PDE4C-211ENST00000597360 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PDE4C-211ENST00000597360 HMGXB3Q12766 1538 aa21.92■■□□□ 1.1
PDE4C-211ENST00000597360 NBR1Q14596 966 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4C-211ENST00000597360 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PDE4C-211ENST00000597360 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PDE4C-211ENST00000597360 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PDE4C-211ENST00000597360 MSH5O43196 834 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4C-211ENST00000597360 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4C-211ENST00000597360 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PDE4C-211ENST00000597360 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PDE4C-211ENST00000597360 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
PDE4C-211ENST00000597360 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4C-211ENST00000597360 SOGA1O94964 1423 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4C-211ENST00000597360 ANP32CO43423 234 aa21.67■■□□□ 1.06
PDE4C-211ENST00000597360 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE4C-211ENST00000597360 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PDE4C-211ENST00000597360 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
PDE4C-211ENST00000597360 ABCC8Q09428 1581 aa21.58■■□□□ 1.04
PDE4C-211ENST00000597360 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PDE4C-211ENST00000597360 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PDE4C-211ENST00000597360 CFTRP13569 1480 aa21.51■■□□□ 1.03
PDE4C-211ENST00000597360 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.5■■□□□ 1.03
PDE4C-211ENST00000597360 CLIP1P30622 1438 aa21.49■■□□□ 1.03
PDE4C-211ENST00000597360 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PDE4C-211ENST00000597360 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms