RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595033.5

FCHO1-208, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-208ENST00000595033 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-208ENST00000595033 ARAP1Q96P48 1450 aa17.95■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.468e-7■■■■■ 28.6
FCHO1-208ENST00000595033 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 ARID3CA6NKF2 412 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 ERCC6Q03468 1493 aa17.89■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 ITGAEP38570 1179 aa17.89■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-208ENST00000595033 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-208ENST00000595033 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-208ENST00000595033 FBLN2P98095 1184 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-208ENST00000595033 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-208ENST00000595033 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-208ENST00000595033 FHOD3Q2V2M9 1422 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-208ENST00000595033 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-208ENST00000595033 KCNH8Q96L42 1107 aa17.79■□□□□ 0.44
FCHO1-208ENST00000595033 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.77■□□□□ 0.44
FCHO1-208ENST00000595033 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.74■□□□□ 0.43
FCHO1-208ENST00000595033 BCANQ96GW7 911 aa17.73■□□□□ 0.43
FCHO1-208ENST00000595033 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.42
FCHO1-208ENST00000595033 WDR97A6NE52 1622 aa17.69■□□□□ 0.42
FCHO1-208ENST00000595033 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.68■□□□□ 0.42
FCHO1-208ENST00000595033 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.68■□□□□ 0.42
FCHO1-208ENST00000595033 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
FCHO1-208ENST00000595033 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
FCHO1-208ENST00000595033 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.59■□□□□ 0.41
FCHO1-208ENST00000595033 FKBP8Q14318 412 aa17.59■□□□□ 0.41
FCHO1-208ENST00000595033 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
FCHO1-208ENST00000595033 CUL7Q14999 1698 aa17.58■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 WDR62O43379 1518 aa17.57■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 PBRM1Q86U86 1689 aa17.56■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 GRIN2BQ13224 1484 aa17.54■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 IFT140Q96RY7 1462 aa17.54■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 PHLDB1Q86UU1 1377 aa17.53■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.52■□□□□ 0.4
FCHO1-208ENST00000595033 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.52■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.52■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 BCL11AQ9H165 835 aa17.48■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa17.48■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 ADAMTS12P58397 1594 aa17.48■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.48■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 TIAM1Q13009 1591 aa17.47■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 TRIM52Q96A61 297 aa17.47■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa17.46■□□□□ 0.39
FCHO1-208ENST00000595033 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
FCHO1-208ENST00000595033 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.43■□□□□ 0.38
FCHO1-208ENST00000595033 MAPKBP1O60336 1514 aa17.42■□□□□ 0.38
FCHO1-208ENST00000595033 IQGAP2Q13576 1575 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 GRIN2AQ12879 1464 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 NEFLP07196 543 aa17.38■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.38■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 FMN1Q68DA7 1419 aa17.38■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.37■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa17.35■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.35■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 JPH4Q96JJ6 628 aa17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 SAMD9Q5K651 1589 aa17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-208ENST00000595033 CEP170Q5SW79 1584 aa17.33■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.32■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.31■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 DISP1Q96F81 1524 aa17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 ANP32CO43423 234 aa17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 SYNJ2O15056 1496 aa17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 PLB1Q6P1J6 1458 aa17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 MSH5O43196 834 aa17.27■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.27■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.27■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.27■□□□□ 0.36
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 NCOA2Q15596 1464 aa17.25■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 CCER2I3L3R5 266 aa17.23■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PTPRKQ15262 1439 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 FGD6Q6ZV73 1430 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 KIAA0556O60303 1618 aa17.21■□□□□ 0.35
FCHO1-208ENST00000595033 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-208ENST00000595033 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-208ENST00000595033 MAP3K1Q13233 1512 aa17.18■□□□□ 0.34
FCHO1-208ENST00000595033 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
FCHO1-208ENST00000595033 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-208ENST00000595033 NUP160Q12769 1436 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 FOXD1Q16676 465 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 HECW1Q76N89 1606 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 CHD1O14646 1710 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 TONSLQ96HA7 1378 aa17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms