RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595033.5

FCHO1-208, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-208ENST00000595033 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
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FCHO1-208ENST00000595033 ARID3CA6NKF2 412 aa17.91■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 ERCC6Q03468 1493 aa17.89■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 ITGAEP38570 1179 aa17.89■□□□□ 0.46
FCHO1-208ENST00000595033 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.88■□□□□ 0.45
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FCHO1-208ENST00000595033 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.52■□□□□ 0.39
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FCHO1-208ENST00000595033 CEP170Q5SW79 1584 aa17.33■□□□□ 0.36
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FCHO1-208ENST00000595033 ANP32CO43423 234 aa17.29■□□□□ 0.36
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FCHO1-208ENST00000595033 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.18■□□□□ 0.34
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FCHO1-208ENST00000595033 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
FCHO1-208ENST00000595033 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
FCHO1-208ENST00000595033 NUP160Q12769 1436 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 FOXD1Q16676 465 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 HECW1Q76N89 1606 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 CHD1O14646 1710 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-208ENST00000595033 TONSLQ96HA7 1378 aa17.1■□□□□ 0.33
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