RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584446.5

GREB1L-211, Transcript of GREB1 like retinoic acid receptor coactivator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GREB1L, Length 3,020 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1L-211ENST00000584446 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.87■■□□□ 1.09
GREB1L-211ENST00000584446 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.85■■□□□ 1.09
GREB1L-211ENST00000584446 TIAM1Q13009 1591 aa21.84■■□□□ 1.09
GREB1L-211ENST00000584446 KCNH8Q96L42 1107 aa21.83■■□□□ 1.08
GREB1L-211ENST00000584446 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.82■■□□□ 1.08
GREB1L-211ENST00000584446 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.81■■□□□ 1.08
GREB1L-211ENST00000584446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.8■■□□□ 1.08
GREB1L-211ENST00000584446 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
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GREB1L-211ENST00000584446 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
GREB1L-211ENST00000584446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.77■■□□□ 1.08
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GREB1L-211ENST00000584446 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.76■■□□□ 1.07
GREB1L-211ENST00000584446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.75■■□□□ 1.07
GREB1L-211ENST00000584446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.73■■□□□ 1.07
GREB1L-211ENST00000584446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.72■■□□□ 1.07
GREB1L-211ENST00000584446 WDR62O43379 1518 aa21.72■■□□□ 1.07
GREB1L-211ENST00000584446 WDR97A6NE52 1622 aa21.7■■□□□ 1.07
GREB1L-211ENST00000584446 MAP3K1Q13233 1512 aa21.7■■□□□ 1.06
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GREB1L-211ENST00000584446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.68■■□□□ 1.06
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GREB1L-211ENST00000584446 BCANQ96GW7 911 aa21.61■■□□□ 1.05
GREB1L-211ENST00000584446 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.6■■□□□ 1.05
GREB1L-211ENST00000584446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
GREB1L-211ENST00000584446 MYT1Q01538 1121 aa21.58■■□□□ 1.05
GREB1L-211ENST00000584446 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.57■■□□□ 1.04
GREB1L-211ENST00000584446 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
GREB1L-211ENST00000584446 TOPBP1Q92547 1522 aa21.55■■□□□ 1.04
GREB1L-211ENST00000584446 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.55■■□□□ 1.04
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GREB1L-211ENST00000584446 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.54■■□□□ 1.04
GREB1L-211ENST00000584446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.53■■□□□ 1.04
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GREB1L-211ENST00000584446 TONSLQ96HA7 1378 aa21.52■■□□□ 1.04
GREB1L-211ENST00000584446 TRIM52Q96A61 297 aa21.52■■□□□ 1.04
GREB1L-211ENST00000584446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GREB1L-211ENST00000584446 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.51■■□□□ 1.03
GREB1L-211ENST00000584446 ANP32CO43423 234 aa21.5■■□□□ 1.03
GREB1L-211ENST00000584446 FKBP8Q14318 412 aa21.5■■□□□ 1.03
GREB1L-211ENST00000584446 FMN1Q68DA7 1419 aa21.49■■□□□ 1.03
GREB1L-211ENST00000584446 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.49■■□□□ 1.03
GREB1L-211ENST00000584446 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.47■■□□□ 1.03
GREB1L-211ENST00000584446 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.45■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.43■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.43■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 ARID3CA6NKF2 412 aa21.41■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 PTPRKQ15262 1439 aa21.41■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.41■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
GREB1L-211ENST00000584446 CUL7Q14999 1698 aa21.4■■□□□ 1.02
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GREB1L-211ENST00000584446 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.38■■□□□ 1.01
GREB1L-211ENST00000584446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.37■■□□□ 1.01
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GREB1L-211ENST00000584446 CCER2I3L3R5 266 aa21.34■■□□□ 1.01
GREB1L-211ENST00000584446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.33■■□□□ 1.01
GREB1L-211ENST00000584446 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.33■■□□□ 1.01
GREB1L-211ENST00000584446 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.32■■□□□ 1
GREB1L-211ENST00000584446 NAIPQ13075 1403 aa21.31■■□□□ 1
GREB1L-211ENST00000584446 IFT140Q96RY7 1462 aa21.3■■□□□ 1
GREB1L-211ENST00000584446 ERCC6Q03468 1493 aa21.3■■□□□ 1
GREB1L-211ENST00000584446 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.28■■□□□ 1
GREB1L-211ENST00000584446 GRIN2BQ13224 1484 aa21.24■□□□□ 0.99
GREB1L-211ENST00000584446 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
GREB1L-211ENST00000584446 FOXD1Q16676 465 aa21.22■□□□□ 0.99
GREB1L-211ENST00000584446 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.22■□□□□ 0.99
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GREB1L-211ENST00000584446 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
GREB1L-211ENST00000584446 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
GREB1L-211ENST00000584446 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.18■□□□□ 0.98
GREB1L-211ENST00000584446 PBRM1Q86U86 1689 aa21.18■□□□□ 0.98
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GREB1L-211ENST00000584446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
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GREB1L-211ENST00000584446 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.06■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.04■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 KDM6BO15054 1643 aa21.04■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 CCDC184Q52MB2 194 aa21.04■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 HECW1Q76N89 1606 aa21.03■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 ARHGEF11O15085 1522 aa21.02■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
GREB1L-211ENST00000584446 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
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