RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557679.5

ZNF410-223, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 5

Gene ZNF410, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-223	ENST00000557679	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		11.37	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	11.37	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCB7	O75027	752 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.35	□□□□□ -0.59
ZNF410-223	ENST00000557679	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.33	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	FBLN2	P98095	1184 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.32	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	SYNJ1	O43426	1573 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.31	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.27	□□□□□ -0.6
ZNF410-223	ENST00000557679	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ZNF410-223	ENST00000557679	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
ZNF410-223	ENST00000557679	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ZNF410-223	ENST00000557679	CHD1	O14646	1710 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF410-223	ENST00000557679	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF410-223	ENST00000557679	KIF27	Q86VH2	1401 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF410-223	ENST00000557679	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF410-223	ENST00000557679	TRIM41	Q8WV44	630 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ZNF410-223	ENST00000557679	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-223	ENST00000557679	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ZNF410-223	ENST00000557679	POLA2	Q14181	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	ARHGEF11	O15085	1522 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	IGF1R	P08069	1367 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	NUP160	Q12769	1436 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	CUL7	Q14999	1698 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ZNF410-223	ENST00000557679	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ZNF410-223	ENST00000557679	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ZNF410-223	ENST00000557679	CEP170	Q5SW79	1584 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ZNF410-223	ENST00000557679	JPH4	Q96JJ6	628 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ZNF410-223	ENST00000557679	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	SHROOM2	Q13796	1616 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	EEA1	Q15075	1411 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ZNF410-223	ENST00000557679	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		10.95	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		10.95	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	IQGAP2	Q13576	1575 aa		10.93	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	POTEH	Q6S545	545 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		10.91	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	PRX	Q9BXM0	1461 aa		10.91	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	10.9	□□□□□ -0.66
ZNF410-223	ENST00000557679	PTPRG	P23470	1445 aa		10.88	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		10.88	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	GOLGA3	Q08378	1498 aa		10.87	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
ZNF410-223	ENST00000557679	DISP1	Q96F81	1524 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ZNF410-223	ENST00000557679	KIAA0556	O60303	1618 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ZNF410-223	ENST00000557679	KIF21B	O75037	1637 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ZNF410-223	ENST00000557679	UACA	Q9BZF9	1416 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ZNF410-223	ENST00000557679	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ZNF410-223	ENST00000557679	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ZNF410-223	ENST00000557679	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	MAPKBP1	O60336	1514 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCC2	Q92887	1545 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	AKT1S1	Q96B36	256 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ZNF410-223	ENST00000557679	SAMD9	Q5K651	1589 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	ASXL2	Q76L83	1435 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	ABCA8	O94911	1581 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	DIP2B	Q9P265	1576 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZNF410-223	ENST00000557679	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		10.65	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	FMN1	Q68DA7	1419 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	GLI2	P10070	1586 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ZNF410-223	ENST00000557679	ARID3C	A6NKF2	412 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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