RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529482.5

TSSC2-204, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSSC2, Length 2,337 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC2-204ENST00000529482 FKBP8Q14318 412 aa22.64■■□□□ 1.22
TSSC2-204ENST00000529482 BCANQ96GW7 911 aa22.64■■□□□ 1.21
TSSC2-204ENST00000529482 CUX1P39880 1505 aa22.63■■□□□ 1.21
TSSC2-204ENST00000529482 MAPKBP1O60336 1514 aa22.61■■□□□ 1.21
TSSC2-204ENST00000529482 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TSSC2-204ENST00000529482 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.58■■□□□ 1.21
TSSC2-204ENST00000529482 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.58■■□□□ 1.2
TSSC2-204ENST00000529482 TOPBP1Q92547 1522 aa22.56■■□□□ 1.2
TSSC2-204ENST00000529482 NEFLP07196 543 aa22.56■■□□□ 1.2
TSSC2-204ENST00000529482 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.54■■□□□ 1.2
TSSC2-204ENST00000529482 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
TSSC2-204ENST00000529482 ITGAEP38570 1179 aa22.52■■□□□ 1.2
TSSC2-204ENST00000529482 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TSSC2-204ENST00000529482 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.5■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 WDR97A6NE52 1622 aa22.49■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 WDR62O43379 1518 aa22.48■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.47■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 KIF27Q86VH2 1401 aa22.47■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 CCER2I3L3R5 266 aa22.46■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.45■■□□□ 1.19
TSSC2-204ENST00000529482 MAP3K1Q13233 1512 aa22.44■■□□□ 1.18
TSSC2-204ENST00000529482 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.42■■□□□ 1.18
TSSC2-204ENST00000529482 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSSC2-204ENST00000529482 TIAM1Q13009 1591 aa22.41■■□□□ 1.18
TSSC2-204ENST00000529482 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.37■■□□□ 1.17
TSSC2-204ENST00000529482 ANP32CO43423 234 aa22.37■■□□□ 1.17
TSSC2-204ENST00000529482 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.36■■□□□ 1.17
TSSC2-204ENST00000529482 TRIM52Q96A61 297 aa22.35■■□□□ 1.17
TSSC2-204ENST00000529482 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.31■■□□□ 1.16
TSSC2-204ENST00000529482 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.27■■□□□ 1.16
TSSC2-204ENST00000529482 MSH5O43196 834 aa22.26■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.25■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 IFT140Q96RY7 1462 aa22.24■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.23■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.22■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TSSC2-204ENST00000529482 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.17■■□□□ 1.14
TSSC2-204ENST00000529482 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSSC2-204ENST00000529482 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSSC2-204ENST00000529482 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TSSC2-204ENST00000529482 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 16.5
TSSC2-204ENST00000529482 IGF1RP08069 1367 aa22.14■■□□□ 1.13
TSSC2-204ENST00000529482 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
TSSC2-204ENST00000529482 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.12■■□□□ 1.13
TSSC2-204ENST00000529482 TONSLQ96HA7 1378 aa22.11■■□□□ 1.13
TSSC2-204ENST00000529482 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSSC2-204ENST00000529482 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.09■■□□□ 1.13
TSSC2-204ENST00000529482 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.08■■□□□ 1.13
TSSC2-204ENST00000529482 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
TSSC2-204ENST00000529482 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.07■■□□□ 1.12
TSSC2-204ENST00000529482 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.07■■□□□ 1.12
TSSC2-204ENST00000529482 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.05■■□□□ 1.12
TSSC2-204ENST00000529482 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TSSC2-204ENST00000529482 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22■■□□□ 1.11
TSSC2-204ENST00000529482 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSSC2-204ENST00000529482 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22■■□□□ 1.11
TSSC2-204ENST00000529482 UACAQ9BZF9 1416 aa21.99■■□□□ 1.11
TSSC2-204ENST00000529482 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.98■■□□□ 1.11
TSSC2-204ENST00000529482 GRIN2BQ13224 1484 aa21.98■■□□□ 1.11
TSSC2-204ENST00000529482 PBRM1Q86U86 1689 aa21.95■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 HFM1A2PYH4 1435 aa21.94■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.94■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.93■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.92■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.91■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 P3H3Q8IVL6 736 aa21.91■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.91■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.9■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.89■■□□□ 1.1
TSSC2-204ENST00000529482 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.86■■□□□ 1.09
TSSC2-204ENST00000529482 CUL7Q14999 1698 aa21.84■■□□□ 1.09
TSSC2-204ENST00000529482 PTPRKQ15262 1439 aa21.84■■□□□ 1.09
TSSC2-204ENST00000529482 NCOA2Q15596 1464 aa21.84■■□□□ 1.09
TSSC2-204ENST00000529482 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TSSC2-204ENST00000529482 NAIPQ13075 1403 aa21.83■■□□□ 1.09
TSSC2-204ENST00000529482 ADAMTS12P58397 1594 aa21.82■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 FBLN2P98095 1184 aa21.81■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.81■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 FMN1Q68DA7 1419 aa21.79■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.77■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.77■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.77■■□□□ 1.08
TSSC2-204ENST00000529482 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 SYNJ2O15056 1496 aa21.76■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.76■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 CCDC184Q52MB2 194 aa21.74■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.73■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 HECW1Q76N89 1606 aa21.71■■□□□ 1.07
TSSC2-204ENST00000529482 GRIN2AQ12879 1464 aa21.71■■□□□ 1.07
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