RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.8■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.8■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.77■□□□□ 0.28
TRPS1-210ENST00000519815 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.77■□□□□ 0.27
TRPS1-210ENST00000519815 GRIN2BQ13224 1484 aa16.74■□□□□ 0.27
TRPS1-210ENST00000519815 CUL7Q14999 1698 aa16.71■□□□□ 0.27
TRPS1-210ENST00000519815 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TRPS1-210ENST00000519815 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.67■□□□□ 0.26
TRPS1-210ENST00000519815 PBRM1Q86U86 1689 aa16.65■□□□□ 0.26
TRPS1-210ENST00000519815 CEP162Q5TB80 1403 aa16.62■□□□□ 0.25
TRPS1-210ENST00000519815 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.61■□□□□ 0.25
TRPS1-210ENST00000519815 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TRPS1-210ENST00000519815 ADAMTS12P58397 1594 aa16.6■□□□□ 0.25
TRPS1-210ENST00000519815 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.59■□□□□ 0.25
TRPS1-210ENST00000519815 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TRPS1-210ENST00000519815 CLIP1P30622 1438 aa16.56■□□□□ 0.24
TRPS1-210ENST00000519815 SYNJ2O15056 1496 aa16.55■□□□□ 0.24
TRPS1-210ENST00000519815 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TRPS1-210ENST00000519815 FBLN2P98095 1184 aa16.53■□□□□ 0.24
TRPS1-210ENST00000519815 GRIN2AQ12879 1464 aa16.52■□□□□ 0.23
TRPS1-210ENST00000519815 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-210ENST00000519815 ZBTB22O15209 634 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.44■□□□□ 0.22
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-210ENST00000519815 NUP160Q12769 1436 aa16.42■□□□□ 0.22
TRPS1-210ENST00000519815 IQGAP2Q13576 1575 aa16.4■□□□□ 0.22
TRPS1-210ENST00000519815 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.38■□□□□ 0.21
TRPS1-210ENST00000519815 ARAP1Q96P48 1450 aa16.38■□□□□ 0.21
TRPS1-210ENST00000519815 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.38■□□□□ 0.21
TRPS1-210ENST00000519815 CEP170Q5SW79 1584 aa16.38■□□□□ 0.21
TRPS1-210ENST00000519815 P3H3Q8IVL6 736 aa16.37■□□□□ 0.21
TRPS1-210ENST00000519815 JPH4Q96JJ6 628 aa16.34■□□□□ 0.21
TRPS1-210ENST00000519815 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.34■□□□□ 0.21
TRPS1-210ENST00000519815 CHD1O14646 1710 aa16.32■□□□□ 0.2
TRPS1-210ENST00000519815 SAMD9Q5K651 1589 aa16.3■□□□□ 0.2
TRPS1-210ENST00000519815 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.3■□□□□ 0.2
TRPS1-210ENST00000519815 APLP2Q06481 763 aa16.29■□□□□ 0.2
TRPS1-210ENST00000519815 FMN1Q68DA7 1419 aa16.28■□□□□ 0.2
TRPS1-210ENST00000519815 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.27■□□□□ 0.19
TRPS1-210ENST00000519815 DISP1Q96F81 1524 aa16.25■□□□□ 0.19
TRPS1-210ENST00000519815 OSCARQ8IYS5 282 aa16.24■□□□□ 0.19
TRPS1-210ENST00000519815 KIAA0556O60303 1618 aa16.22■□□□□ 0.19
TRPS1-210ENST00000519815 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TRPS1-210ENST00000519815 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.2■□□□□ 0.18
TRPS1-210ENST00000519815 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.2■□□□□ 0.18
TRPS1-210ENST00000519815 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TRPS1-210ENST00000519815 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TRPS1-210ENST00000519815 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.17■□□□□ 0.18
TRPS1-210ENST00000519815 SHROOM2Q13796 1616 aa16.16■□□□□ 0.18
TRPS1-210ENST00000519815 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TRPS1-210ENST00000519815 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TRPS1-210ENST00000519815 MAP3K1Q13233 1512 aa16.14■□□□□ 0.17
TRPS1-210ENST00000519815 PTPRGP23470 1445 aa16.12■□□□□ 0.17
TRPS1-210ENST00000519815 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TRPS1-210ENST00000519815 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TRPS1-210ENST00000519815 RNF39Q9H2S5 420 aa16.1■□□□□ 0.17
TRPS1-210ENST00000519815 TIAM1Q13009 1591 aa16.07■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 HECW1Q76N89 1606 aa16.06■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.05■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa16.04■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.03■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.02■□□□□ 0.16
TRPS1-210ENST00000519815 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 ABCA8O94911 1581 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 CFAP43Q8NDM7 1665 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 UACAQ9BZF9 1416 aa16.01■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 ARID3CA6NKF2 412 aa16■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 MTUS2Q5JR59 1369 aa16■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TRPS1-210ENST00000519815 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPS1-210ENST00000519815 ATP10BO94823 1461 aa15.94■□□□□ 0.14
TRPS1-210ENST00000519815 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPS1-210ENST00000519815 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPS1-210ENST00000519815 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
TRPS1-210ENST00000519815 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPS1-210ENST00000519815 ABCC2Q92887 1545 aa15.93■□□□□ 0.14
TRPS1-210ENST00000519815 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.89■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.88■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 ARHGEF11O15085 1522 aa15.87■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 NCOA2Q15596 1464 aa15.86■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.84■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.84■□□□□ 0.13
TRPS1-210ENST00000519815 SLC4A2P04920 1241 aa15.82■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
TRPS1-210ENST00000519815 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.81■□□□□ 0.12
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