RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518046.1

HOXA-AS2-204, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA-AS2, Length 422 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
HOXA-AS2-204ENST00000518046 NESP48681 1621 aa7.7□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CHADLQ6NUI6 762 aa7.68□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PLEKHG5O94827 1062 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ERCC6Q03468 1493 aa7.67□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MIER1Q8N108 512 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CREBZFQ9NS37 354 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.65□□□□□ -1.18
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.63□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CUX2O14529 1486 aa7.62□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.6□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.59□□□□□ -1.19
HOXA-AS2-204ENST00000518046 HAX1O00165 279 aa7.58□□□□□ -1.2
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CFTRP13569 1480 aa7.55□□□□□ -1.2
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.54□□□□□ -1.2
HOXA-AS2-204ENST00000518046 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.52□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.52□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KLHL34Q8N239 644 aa7.52□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PRDM2Q13029 1718 aa7.52□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.51□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.51□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.5□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 WDR62O43379 1518 aa7.5□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HOXA-AS2-204ENST00000518046 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.45□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 EVX2Q03828 476 aa7.44□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SPOCK2Q92563 424 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 NUBP1P53384 320 aa7.42□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 RASEFQ8IZ41 740 aa7.41□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 FAM212AQ96EL1 285 aa7.41□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TOPBP1Q92547 1522 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CLCN6P51797 869 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.38□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ABCC8Q09428 1581 aa7.37□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 GSE1Q14687 1217 aa7.36□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 IFT140Q96RY7 1462 aa7.36□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.35□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PHF12Q96QT6 1004 aa7.34□□□□□ -1.23
HOXA-AS2-204ENST00000518046 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 GABBR2O75899 941 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CUX1P39880 1505 aa7.32□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SOGA1O94964 1423 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 KIF12Q96FN5 646 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PYGBP11216 843 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXA-AS2-204ENST00000518046 WDR97A6NE52 1622 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MAP3K13O43283 966 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TRIM41Q8WV44 630 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CHD1O14646 1710 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.26□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.24□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SYNJ1O43426 1573 aa7.24□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TOP2BQ02880 1626 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 PBRM1Q86U86 1689 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SLC24A1O60721 1099 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 GRIN2BQ13224 1484 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 IFNL1Q8IU54 200 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ARHGEF11O15085 1522 aa7.18□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 SYNJ2O15056 1496 aa7.17□□□□□ -1.26
HOXA-AS2-204ENST00000518046 TIE1P35590 1138 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms