RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511307.5

SH3TC2-209, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3TC2, Length 3,276 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3TC2-209ENST00000511307 MIA2Q96PC5 1412 aa14.56□□□□□ -0.08
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