RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510557.5

LIN54-209, Transcript of lin-54 DREAM MuvB core complex component, humanhuman

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Gene LIN54, Length 2,257 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN54-209ENST00000510557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.68■■■□□ 2.02
LIN54-209ENST00000510557 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.68■■■□□ 2.02
LIN54-209ENST00000510557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.68■■■□□ 2.02
LIN54-209ENST00000510557 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.63■■■□□ 2.01
LIN54-209ENST00000510557 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.6■■■□□ 2.01
LIN54-209ENST00000510557 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.6■■■□□ 2.01
LIN54-209ENST00000510557 ITGAEP38570 1179 aa27.59■■■□□ 2.01
LIN54-209ENST00000510557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.59■■■□□ 2.01
LIN54-209ENST00000510557 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.57■■■□□ 2
LIN54-209ENST00000510557 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.57■■■□□ 2
LIN54-209ENST00000510557 CUL7Q14999 1698 aa27.53■■■□□ 2
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LIN54-209ENST00000510557 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.51■■□□□ 1.99
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LIN54-209ENST00000510557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
LIN54-209ENST00000510557 MAPKBP1O60336 1514 aa27.49■■□□□ 1.99
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LIN54-209ENST00000510557 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.39■■□□□ 1.98
LIN54-209ENST00000510557 P3H3Q8IVL6 736 aa27.39■■□□□ 1.98
LIN54-209ENST00000510557 FMN1Q68DA7 1419 aa27.38■■□□□ 1.97
LIN54-209ENST00000510557 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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LIN54-209ENST00000510557 NESP48681 1621 aa27.3■■□□□ 1.96
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LIN54-209ENST00000510557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.21■■□□□ 1.95
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LIN54-209ENST00000510557 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.18■■□□□ 1.94
LIN54-209ENST00000510557 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.18■■□□□ 1.94
LIN54-209ENST00000510557 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
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LIN54-209ENST00000510557 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.16■■□□□ 1.94
LIN54-209ENST00000510557 BCANQ96GW7 911 aa27.13■■□□□ 1.93
LIN54-209ENST00000510557 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
LIN54-209ENST00000510557 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
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LIN54-209ENST00000510557 GRIN2BQ13224 1484 aa27.09■■□□□ 1.93
LIN54-209ENST00000510557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.08■■□□□ 1.93
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LIN54-209ENST00000510557 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
LIN54-209ENST00000510557 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.07■■□□□ 1.92
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LIN54-209ENST00000510557 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.01■■□□□ 1.91
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LIN54-209ENST00000510557 NEFLP07196 543 aa26.96■■□□□ 1.91
LIN54-209ENST00000510557 NAIPQ13075 1403 aa26.95■■□□□ 1.9
LIN54-209ENST00000510557 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
LIN54-209ENST00000510557 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.94■■□□□ 1.9
LIN54-209ENST00000510557 CCER2I3L3R5 266 aa26.93■■□□□ 1.9
LIN54-209ENST00000510557 ARHGEF11O15085 1522 aa26.93■■□□□ 1.9
LIN54-209ENST00000510557 HECW1Q76N89 1606 aa26.89■■□□□ 1.9
LIN54-209ENST00000510557 ANP32CO43423 234 aa26.89■■□□□ 1.9
LIN54-209ENST00000510557 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
LIN54-209ENST00000510557 PBRM1Q86U86 1689 aa26.85■■□□□ 1.89
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LIN54-209ENST00000510557 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.8■■□□□ 1.88
LIN54-209ENST00000510557 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.8■■□□□ 1.88
LIN54-209ENST00000510557 MIA2Q96PC5 1412 aa26.79■■□□□ 1.88
LIN54-209ENST00000510557 MSH5O43196 834 aa26.79■■□□□ 1.88
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LIN54-209ENST00000510557 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
LIN54-209ENST00000510557 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.73■■□□□ 1.87
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LIN54-209ENST00000510557 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.69■■□□□ 1.86
LIN54-209ENST00000510557 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.69■■□□□ 1.86
LIN54-209ENST00000510557 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.69■■□□□ 1.86
LIN54-209ENST00000510557 TRIM52Q96A61 297 aa26.64■■□□□ 1.86
LIN54-209ENST00000510557 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.64■■□□□ 1.86
LIN54-209ENST00000510557 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.64■■□□□ 1.85
LIN54-209ENST00000510557 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.63■■□□□ 1.85
LIN54-209ENST00000510557 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
LIN54-209ENST00000510557 ROCK1Q13464 1354 aa26.6■■□□□ 1.85
LIN54-209ENST00000510557 IFT140Q96RY7 1462 aa26.6■■□□□ 1.85
LIN54-209ENST00000510557 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.59■■□□□ 1.85
LIN54-209ENST00000510557 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LIN54-209ENST00000510557 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
LIN54-209ENST00000510557 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.57■■□□□ 1.84
LIN54-209ENST00000510557 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
LIN54-209ENST00000510557 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
LIN54-209ENST00000510557 KDM6BO15054 1643 aa26.53■■□□□ 1.84
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