RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 MRC2Q9UBG0 1479 aa16.43■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.43■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 SPDYE6P0CI01 402 aa16.43■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.43■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.43■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.41■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 TOP2BQ02880 1626 aa16.41■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
CTPS1-211ENST00000497210 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.39■□□□□ 0.21
CTPS1-211ENST00000497210 SYNJ1O43426 1573 aa16.38■□□□□ 0.21
CTPS1-211ENST00000497210 WDR62O43379 1518 aa16.38■□□□□ 0.21
CTPS1-211ENST00000497210 CUX1P39880 1505 aa16.37■□□□□ 0.21
CTPS1-211ENST00000497210 TOPBP1Q92547 1522 aa16.35■□□□□ 0.21
CTPS1-211ENST00000497210 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CTPS1-211ENST00000497210 TRIM41Q8WV44 630 aa16.29■□□□□ 0.2
CTPS1-211ENST00000497210 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
CTPS1-211ENST00000497210 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.27■□□□□ 0.19
CTPS1-211ENST00000497210 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CTPS1-211ENST00000497210 CUX2O14529 1486 aa16.2■□□□□ 0.18
CTPS1-211ENST00000497210 WDR97A6NE52 1622 aa16.19■□□□□ 0.18
CTPS1-211ENST00000497210 IFT140Q96RY7 1462 aa16.18■□□□□ 0.18
CTPS1-211ENST00000497210 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.15■□□□□ 0.18
CTPS1-211ENST00000497210 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CTPS1-211ENST00000497210 SOGA1O94964 1423 aa16.14■□□□□ 0.17
CTPS1-211ENST00000497210 EEA1Q15075 1411 aa16.12■□□□□ 0.17
CTPS1-211ENST00000497210 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CTPS1-211ENST00000497210 KIF27Q86VH2 1401 aa16.1■□□□□ 0.17
CTPS1-211ENST00000497210 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.1■□□□□ 0.17
CTPS1-211ENST00000497210 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.08■□□□□ 0.17
CTPS1-211ENST00000497210 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.07■□□□□ 0.16
CTPS1-211ENST00000497210 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTPS1-211ENST00000497210 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTPS1-211ENST00000497210 PBRM1Q86U86 1689 aa16.03■□□□□ 0.16
CTPS1-211ENST00000497210 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.01■□□□□ 0.15
CTPS1-211ENST00000497210 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16■□□□□ 0.15
CTPS1-211ENST00000497210 CUL7Q14999 1698 aa16■□□□□ 0.15
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CTPS1-211ENST00000497210 GRIN2BQ13224 1484 aa15.97■□□□□ 0.15
CTPS1-211ENST00000497210 AKT1S1Q96B36 256 aa15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-211ENST00000497210 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CTPS1-211ENST00000497210 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.93■□□□□ 0.14
CTPS1-211ENST00000497210 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.143e-9■■■■■ 31.5
CTPS1-211ENST00000497210 KIF21BO75037 1637 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-211ENST00000497210 ADAMTS12P58397 1594 aa15.92■□□□□ 0.14
CTPS1-211ENST00000497210 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CTPS1-211ENST00000497210 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.88■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 IGF1RP08069 1367 aa15.86■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 PRXQ9BXM0 1461 aa15.85■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.85■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 GOLGA3Q08378 1498 aa15.84■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 MIER1Q8N108 512 aa15.84■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.84■□□□□ 0.13
CTPS1-211ENST00000497210 KLHL34Q8N239 644 aa15.83■□□□□ 0.12
CTPS1-211ENST00000497210 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CTPS1-211ENST00000497210 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.82■□□□□ 0.12
CTPS1-211ENST00000497210 SYNJ2O15056 1496 aa15.82■□□□□ 0.12
CTPS1-211ENST00000497210 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CTPS1-211ENST00000497210 SPOCK2Q92563 424 aa15.8■□□□□ 0.12
CTPS1-211ENST00000497210 GRIN2AQ12879 1464 aa15.77■□□□□ 0.11
CTPS1-211ENST00000497210 CHD1O14646 1710 aa15.75■□□□□ 0.11
CTPS1-211ENST00000497210 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.75■□□□□ 0.11
CTPS1-211ENST00000497210 PKD2Q13563 968 aa15.74■□□□□ 0.11
CTPS1-211ENST00000497210 PLEKHG5O94827 1062 aa15.71■□□□□ 0.11
CTPS1-211ENST00000497210 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CTPS1-211ENST00000497210 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.7■□□□□ 0.1
CTPS1-211ENST00000497210 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CTPS1-211ENST00000497210 NUP160Q12769 1436 aa15.66■□□□□ 0.1
CTPS1-211ENST00000497210 CEP170Q5SW79 1584 aa15.66■□□□□ 0.1
CTPS1-211ENST00000497210 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CTPS1-211ENST00000497210 IQGAP2Q13576 1575 aa15.65■□□□□ 0.1
CTPS1-211ENST00000497210 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.64■□□□□ 0.09
CTPS1-211ENST00000497210 PITPNM1O00562 1244 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-211ENST00000497210 PRR29P0C7W0 189 aa15.63■□□□□ 0.09
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.61■□□□□ 0.09
CTPS1-211ENST00000497210 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.59■□□□□ 0.09
CTPS1-211ENST00000497210 CREBZFQ9NS37 354 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-211ENST00000497210 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.58■□□□□ 0.08
CTPS1-211ENST00000497210 CEP162Q5TB80 1403 aa15.56■□□□□ 0.08
CTPS1-211ENST00000497210 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.55■□□□□ 0.08
CTPS1-211ENST00000497210 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.54■□□□□ 0.08
CTPS1-211ENST00000497210 SLC24A1O60721 1099 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-211ENST00000497210 SHROOM2Q13796 1616 aa15.53■□□□□ 0.08
CTPS1-211ENST00000497210 SAMD9Q5K651 1589 aa15.52■□□□□ 0.07
CTPS1-211ENST00000497210 CLIP1P30622 1438 aa15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-211ENST00000497210 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CTPS1-211ENST00000497210 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CTPS1-211ENST00000497210 KIAA0556O60303 1618 aa15.49■□□□□ 0.07
CTPS1-211ENST00000497210 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-211ENST00000497210 NUBP1P53384 320 aa15.47■□□□□ 0.07
CTPS1-211ENST00000497210 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.45■□□□□ 0.06
CTPS1-211ENST00000497210 DISP1Q96F81 1524 aa15.42■□□□□ 0.06
CTPS1-211ENST00000497210 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CTPS1-211ENST00000497210 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CTPS1-211ENST00000497210 JPH4Q96JJ6 628 aa15.4■□□□□ 0.06
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