RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 WDR97A6NE52 1622 aa26.59■■□□□ 1.85
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PTPRG-207ENST00000495879 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.57■■□□□ 1.84
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PTPRG-207ENST00000495879 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.1■■□□□ 1.77
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PTPRG-207ENST00000495879 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.91■■□□□ 1.74
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PTPRG-207ENST00000495879 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.89■■□□□ 1.73
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PTPRG-207ENST00000495879 MRS2Q9HD23 443 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRG-207ENST00000495879 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.78■■□□□ 1.72
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PTPRG-207ENST00000495879 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.71■■□□□ 1.71
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PTPRG-207ENST00000495879 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTPRG-207ENST00000495879 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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PTPRG-207ENST00000495879 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.52■■□□□ 1.68
PTPRG-207ENST00000495879 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 NCOA1Q15788 1441 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 AKNAQ7Z591 1439 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRG-207ENST00000495879 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.49■■□□□ 1.67
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