RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484046.1

TM4SF1-AS1-201, TM4SF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TM4SF1-AS1, Length 488 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.19□□□□□ -0.62
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TOPBP1Q92547 1522 aa11.18□□□□□ -0.62
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FBXO41Q8TF61 875 aa11.17□□□□□ -0.62
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SYNJ1O43426 1573 aa11.15□□□□□ -0.62
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.12□□□□□ -0.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HECW2Q9P2P5 1572 aa11.12□□□□□ -0.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 APLP2Q06481 763 aa11.11□□□□□ -0.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.11□□□□□ -0.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 WIZO95785 1651 aa11.11□□□□□ -0.63
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABCC8Q09428 1581 aa11.08□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.08□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRDM2Q13029 1718 aa11.06□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SOCS7O14512 581 aa11.06□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DNMBPQ6XZF7 1577 aa11.06□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KDM6BO15054 1643 aa11.02□□□□□ -0.64
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADGRL1O94910 1474 aa11.01□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CAPN15O75808 1086 aa11.01□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SYNJ2O15056 1496 aa11□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 WDR97A6NE52 1622 aa10.98□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ILDR2Q71H61 639 aa10.98□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.97□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FAM69CQ0P6D2 419 aa10.96□□□□□ -0.65
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GRIN2BQ13224 1484 aa10.94□□□□□ -0.66
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DIP2BQ9P265 1576 aa10.94□□□□□ -0.66
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SOGA1O94964 1423 aa10.92□□□□□ -0.66
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CEP170Q5SW79 1584 aa10.91□□□□□ -0.66
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAPKBP1O60336 1514 aa10.9□□□□□ -0.66
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DSG3P32926 999 aa10.88□□□□□ -0.67
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 POLA2Q14181 598 aa10.87□□□□□ -0.67
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.87□□□□□ -0.67
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SHROOM2Q13796 1616 aa10.86□□□□□ -0.67
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABCB7O75027 752 aa10.85□□□□□ -0.67
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.83□□□□□ -0.68
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NUP160Q12769 1436 aa10.83□□□□□ -0.68
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.82□□□□□ -0.68
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GRIN2AQ12879 1464 aa10.81□□□□□ -0.68
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PBRM1Q86U86 1689 aa10.79□□□□□ -0.68
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.77□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TSPOAP1O95153 1857 aa10.76□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.74□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TOP2BQ02880 1626 aa10.73□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.73□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.73□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADAMTS12P58397 1594 aa10.69□□□□□ -0.7
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CUX1P39880 1505 aa10.69□□□□□ -0.7
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.67□□□□□ -0.7
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 GLI2P10070 1586 aa10.66□□□□□ -0.7
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CERKQ8TCT0 537 aa10.64□□□□□ -0.71
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 JPH4Q96JJ6 628 aa10.64□□□□□ -0.71
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FKBP8Q14318 412 aa10.63□□□□□ -0.71
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.63□□□□□ -0.71
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PTPRMP28827 1452 aa10.59□□□□□ -0.71
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.58□□□□□ -0.72
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.58□□□□□ -0.72
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.58□□□□□ -0.72
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ASXL2Q76L83 1435 aa10.58□□□□□ -0.72
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa10.55□□□□□ -0.72
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ABCC2Q92887 1545 aa10.55□□□□□ -0.72
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIF21BO75037 1637 aa10.52□□□□□ -0.73
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ADAMTSL3P82987 1691 aa10.51□□□□□ -0.73
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPDYE4A6NLX3 237 aa10.51□□□□□ -0.73
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.51□□□□□ -0.73
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.5□□□□□ -0.73
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 HSPA2P54652 639 aa10.47□□□□□ -0.73
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PTPRGP23470 1445 aa10.46□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 PROM2Q8N271 834 aa10.45□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.44□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CUL7Q14999 1698 aa10.43□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPDYE2BA6NHP3 402 aa10.42□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPDYE6P0CI01 402 aa10.42□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SPDYE2Q495Y8 402 aa10.42□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MADDQ8WXG6 1647 aa10.41□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.41□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10.4□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.4□□□□□ -0.74
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 TNIKQ9UKE5 1360 aa10.39□□□□□ -0.75
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 BCORL1Q5H9F3 1711 aa10.38□□□□□ -0.75
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 UACAQ9BZF9 1416 aa10.37□□□□□ -0.75
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 CD109Q6YHK3 1445 aa10.35□□□□□ -0.75
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 ARAP3Q8WWN8 1544 aa10.35□□□□□ -0.75
TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 WDR7Q9Y4E6 1490 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms