RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473771.1

SAG-210, Transcript of S-antigen visual arrestin, humanhuman

TSL 5

Gene SAG, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAG-210ENST00000473771 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.5□□□□□ -1.05
SAG-210ENST00000473771 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.49□□□□□ -1.05
SAG-210ENST00000473771 CUX1P39880 1505 aa8.49□□□□□ -1.05
SAG-210ENST00000473771 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.45□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 RNF39Q9H2S5 420 aa8.45□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.44□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 SOGA1O94964 1423 aa8.44□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 FBLN2P98095 1184 aa8.42□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.42□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.42□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.42□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 WDR97A6NE52 1622 aa8.42□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 PRXQ9BXM0 1461 aa8.41□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.4□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 GOLGA3Q08378 1498 aa8.4□□□□□ -1.06
SAG-210ENST00000473771 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.39□□□□□ -1.07
SAG-210ENST00000473771 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.38□□□□□ -1.07
SAG-210ENST00000473771 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.35□□□□□ -1.07
SAG-210ENST00000473771 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SAG-210ENST00000473771 TOPBP1Q92547 1522 aa8.34□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.34□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 KIF27Q86VH2 1401 aa8.33□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.32□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 CEP162Q5TB80 1403 aa8.32□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 HRCP23327 699 aa8.32□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.32□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.31□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 NBR1Q14596 966 aa8.31□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 CUL7Q14999 1698 aa8.3□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 NESP48681 1621 aa8.3□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.3□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SAG-210ENST00000473771 IGF1RP08069 1367 aa8.26□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 WDR62O43379 1518 aa8.25□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 CUX2O14529 1486 aa8.23□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.23□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.22□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.22□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 CLIP1P30622 1438 aa8.21□□□□□ -1.09
SAG-210ENST00000473771 MAP3K1Q13233 1512 aa8.21□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 PBRM1Q86U86 1689 aa8.2□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 ARAP1Q96P48 1450 aa8.19□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.19□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 CFAP44Q96MT7 982 aa8.18□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.18□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.18□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.17□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 SAMD9Q5K651 1589 aa8.17□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 ADAMTS12P58397 1594 aa8.15□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.15□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 IFT140Q96RY7 1462 aa8.15□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SAG-210ENST00000473771 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.14□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.14□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 PLEKHG5O94827 1062 aa8.13□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 GRIN2BQ13224 1484 aa8.1□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.1□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.09□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 TIAM1Q13009 1591 aa8.09□□□□□ -1.11
SAG-210ENST00000473771 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.08□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.08□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.08□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.06□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 PKD2Q13563 968 aa8.06□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.06□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.05□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.05□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.05□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 IQGAP2Q13576 1575 aa8.05□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.04□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 FMN1Q68DA7 1419 aa8.03□□□□□ -1.12
SAG-210ENST00000473771 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.02□□□□□ -1.13
SAG-210ENST00000473771 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
SAG-210ENST00000473771 ARHGEF11O15085 1522 aa8.01□□□□□ -1.13
SAG-210ENST00000473771 NUP160Q12769 1436 aa8.01□□□□□ -1.13
SAG-210ENST00000473771 SYNJ2O15056 1496 aa8□□□□□ -1.13
SAG-210ENST00000473771 GRIN2AQ12879 1464 aa8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110 ms