RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SYNE4-204ENST00000465425 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SYNE4-204ENST00000465425 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.82■■□□□ 1.88
SYNE4-204ENST00000465425 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SYNE4-204ENST00000465425 NESP48681 1621 aa26.81■■□□□ 1.88
SYNE4-204ENST00000465425 P3H3Q8IVL6 736 aa26.78■■□□□ 1.88
SYNE4-204ENST00000465425 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 CUL7Q14999 1698 aa26.73■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.72■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.71■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.71■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.71■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.7■■□□□ 1.87
SYNE4-204ENST00000465425 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.69■■□□□ 1.86
SYNE4-204ENST00000465425 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-204ENST00000465425 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SYNE4-204ENST00000465425 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.65■■□□□ 1.86
SYNE4-204ENST00000465425 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-204ENST00000465425 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-204ENST00000465425 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.62■■□□□ 1.85
SYNE4-204ENST00000465425 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.853e-7■■■■■ 30.6
SYNE4-204ENST00000465425 FMN1Q68DA7 1419 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-204ENST00000465425 WDR97A6NE52 1622 aa26.57■■□□□ 1.84
SYNE4-204ENST00000465425 MAPKBP1O60336 1514 aa26.56■■□□□ 1.84
SYNE4-204ENST00000465425 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.55■■□□□ 1.84
SYNE4-204ENST00000465425 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SYNE4-204ENST00000465425 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.5■■□□□ 1.83
SYNE4-204ENST00000465425 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.5■■□□□ 1.83
SYNE4-204ENST00000465425 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.45■■□□□ 1.82
SYNE4-204ENST00000465425 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.45■■□□□ 1.82
SYNE4-204ENST00000465425 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.43■■□□□ 1.82
SYNE4-204ENST00000465425 SAMD9Q5K651 1589 aa26.4■■□□□ 1.82
SYNE4-204ENST00000465425 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.39■■□□□ 1.82
SYNE4-204ENST00000465425 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.36■■□□□ 1.81
SYNE4-204ENST00000465425 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.36■■□□□ 1.81
SYNE4-204ENST00000465425 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.33■■□□□ 1.81
SYNE4-204ENST00000465425 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SYNE4-204ENST00000465425 GRIN2BQ13224 1484 aa26.29■■□□□ 1.8
SYNE4-204ENST00000465425 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SYNE4-204ENST00000465425 NCOA2Q15596 1464 aa26.26■■□□□ 1.79
SYNE4-204ENST00000465425 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.24■■□□□ 1.79
SYNE4-204ENST00000465425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.24■■□□□ 1.79
SYNE4-204ENST00000465425 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.23■■□□□ 1.79
SYNE4-204ENST00000465425 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.22■■□□□ 1.79
SYNE4-204ENST00000465425 HFM1A2PYH4 1435 aa26.22■■□□□ 1.79
SYNE4-204ENST00000465425 PTPRKQ15262 1439 aa26.17■■□□□ 1.78
SYNE4-204ENST00000465425 PBRM1Q86U86 1689 aa26.17■■□□□ 1.78
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SYNE4-204ENST00000465425 UACAQ9BZF9 1416 aa26.16■■□□□ 1.78
SYNE4-204ENST00000465425 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.15■■□□□ 1.78
SYNE4-204ENST00000465425 IQGAP2Q13576 1575 aa26.13■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 TONSLQ96HA7 1378 aa26.13■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.12■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 HECW1Q76N89 1606 aa26.11■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.11■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 NAIPQ13075 1403 aa26.11■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 ADAMTS12P58397 1594 aa26.1■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGEF11O15085 1522 aa26.08■■□□□ 1.77
SYNE4-204ENST00000465425 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.07■■□□□ 1.76
SYNE4-204ENST00000465425 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SYNE4-204ENST00000465425 KCNH8Q96L42 1107 aa26■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.97■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 IFT140Q96RY7 1462 aa25.97■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.97■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 WDR62O43379 1518 aa25.96■■□□□ 1.75
SYNE4-204ENST00000465425 MIA2Q96PC5 1412 aa25.94■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 ARID3CA6NKF2 412 aa25.93■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 AKNAQ7Z591 1439 aa25.91■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.9■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 ANP32CO43423 234 aa25.89■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 TRIM52Q96A61 297 aa25.89■■□□□ 1.74
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.88■■□□□ 1.73
SYNE4-204ENST00000465425 CCER2I3L3R5 266 aa25.83■■□□□ 1.73
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA0556O60303 1618 aa25.83■■□□□ 1.73
SYNE4-204ENST00000465425 DISP1Q96F81 1524 aa25.81■■□□□ 1.72
SYNE4-204ENST00000465425 GRIN2AQ12879 1464 aa25.79■■□□□ 1.72
SYNE4-204ENST00000465425 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SYNE4-204ENST00000465425 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.78■■□□□ 1.72
SYNE4-204ENST00000465425 KDM6BO15054 1643 aa25.76■■□□□ 1.72
SYNE4-204ENST00000465425 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.76■■□□□ 1.71
SYNE4-204ENST00000465425 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SYNE4-204ENST00000465425 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SYNE4-204ENST00000465425 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SYNE4-204ENST00000465425 DAPK1P53355 1430 aa25.74■■□□□ 1.71
SYNE4-204ENST00000465425 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.73■■□□□ 1.71
SYNE4-204ENST00000465425 ROCK1Q13464 1354 aa25.72■■□□□ 1.71
SYNE4-204ENST00000465425 ERCC6Q03468 1493 aa25.7■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC5O15440 1437 aa25.67■■□□□ 1.7
SYNE4-204ENST00000465425 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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