RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 TOPBP1Q92547 1522 aa24.83■■□□□ 1.57
ACTB-207ENST00000462494 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
ACTB-207ENST00000462494 MAP3K1Q13233 1512 aa24.81■■□□□ 1.56
ACTB-207ENST00000462494 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.8■■□□□ 1.56
ACTB-207ENST00000462494 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-207ENST00000462494 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.79■■□□□ 1.56
ACTB-207ENST00000462494 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-207ENST00000462494 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-207ENST00000462494 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-207ENST00000462494 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-207ENST00000462494 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ACTB-207ENST00000462494 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ACTB-207ENST00000462494 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-207ENST00000462494 CUL7Q14999 1698 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-207ENST00000462494 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.64■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-207ENST00000462494 MAPKBP1O60336 1514 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-207ENST00000462494 WDR97A6NE52 1622 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-207ENST00000462494 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.53■■□□□ 1.52
ACTB-207ENST00000462494 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.523e-16■■■■■ 37.4
ACTB-207ENST00000462494 FMN1Q68DA7 1419 aa24.52■■□□□ 1.52
ACTB-207ENST00000462494 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.51■■□□□ 1.51
ACTB-207ENST00000462494 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.5■■□□□ 1.51
ACTB-207ENST00000462494 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.48■■□□□ 1.51
ACTB-207ENST00000462494 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.47■■□□□ 1.51
ACTB-207ENST00000462494 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-207ENST00000462494 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.44■■□□□ 1.5
ACTB-207ENST00000462494 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.41■■□□□ 1.5
ACTB-207ENST00000462494 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.39■■□□□ 1.5
ACTB-207ENST00000462494 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.54e-28■■□□□ 12.2
ACTB-207ENST00000462494 SAMD9Q5K651 1589 aa24.39■■□□□ 1.49
ACTB-207ENST00000462494 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-207ENST00000462494 GRIN2BQ13224 1484 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-207ENST00000462494 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
ACTB-207ENST00000462494 NCOA2Q15596 1464 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-207ENST00000462494 PTPRKQ15262 1439 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 HFM1A2PYH4 1435 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 PBRM1Q86U86 1689 aa24.2■■□□□ 1.47
ACTB-207ENST00000462494 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.18■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 KCNH8Q96L42 1107 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 TONSLQ96HA7 1378 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 UACAQ9BZF9 1416 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.15■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 NAIPQ13075 1403 aa24.14■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 IQGAP2Q13576 1575 aa24.14■■□□□ 1.46
ACTB-207ENST00000462494 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.14■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 ARID3CA6NKF2 412 aa24.13■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.12■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 ADAMTS12P58397 1594 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 HECW1Q76N89 1606 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.11■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.1■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 ARHGEF11O15085 1522 aa24.08■■□□□ 1.45
ACTB-207ENST00000462494 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ACTB-207ENST00000462494 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ACTB-207ENST00000462494 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ACTB-207ENST00000462494 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ACTB-207ENST00000462494 TRIM52Q96A61 297 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-207ENST00000462494 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
ACTB-207ENST00000462494 WDR62O43379 1518 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-207ENST00000462494 IFT140Q96RY7 1462 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-207ENST00000462494 ANP32CO43423 234 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-207ENST00000462494 MIA2Q96PC5 1412 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-207ENST00000462494 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-207ENST00000462494 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-207ENST00000462494 KDM6BO15054 1643 aa23.9■■□□□ 1.42
ACTB-207ENST00000462494 DISP1Q96F81 1524 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 KIAA0556O60303 1618 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 AKNAQ7Z591 1439 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 CCER2I3L3R5 266 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 GRIN2AQ12879 1464 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-207ENST00000462494 FOXD1Q16676 465 aa23.83■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 DAPK1P53355 1430 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.79■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 ERCC6Q03468 1493 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 FBLN2P98095 1184 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-207ENST00000462494 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms