RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TOP3B-206ENST00000436282 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.47■■□□□ 1.03
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.43■■□□□ 1.02
TOP3B-206ENST00000436282 TOPBP1Q92547 1522 aa21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-206ENST00000436282 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TOP3B-206ENST00000436282 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.41■■□□□ 1.02
TOP3B-206ENST00000436282 MAPKBP1O60336 1514 aa21.38■■□□□ 1.01
TOP3B-206ENST00000436282 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.36■■□□□ 1.01
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.35■■□□□ 1.01
TOP3B-206ENST00000436282 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.34■■□□□ 1.01
TOP3B-206ENST00000436282 KCNH8Q96L42 1107 aa21.32■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.31■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 TIAM1Q13009 1591 aa21.29■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 MAP3K1Q13233 1512 aa21.29■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.28■■□□□ 1
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.26■□□□□ 0.99
TOP3B-206ENST00000436282 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.25■□□□□ 0.99
TOP3B-206ENST00000436282 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.24■□□□□ 0.99
TOP3B-206ENST00000436282 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.24■□□□□ 0.99
TOP3B-206ENST00000436282 WDR97A6NE52 1622 aa21.23■□□□□ 0.99
TOP3B-206ENST00000436282 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.22■□□□□ 0.99
TOP3B-206ENST00000436282 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
TOP3B-206ENST00000436282 FKBP8Q14318 412 aa21.19■□□□□ 0.98
TOP3B-206ENST00000436282 BCANQ96GW7 911 aa21.18■□□□□ 0.98
TOP3B-206ENST00000436282 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
TOP3B-206ENST00000436282 CUL7Q14999 1698 aa21.16■□□□□ 0.98
TOP3B-206ENST00000436282 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.15■□□□□ 0.98
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
TOP3B-206ENST00000436282 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.15■□□□□ 0.98
TOP3B-206ENST00000436282 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.11■□□□□ 0.97
TOP3B-206ENST00000436282 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.11■□□□□ 0.97
TOP3B-206ENST00000436282 CCER2I3L3R5 266 aa21.11■□□□□ 0.97
TOP3B-206ENST00000436282 NEFLP07196 543 aa21.11■□□□□ 0.97
TOP3B-206ENST00000436282 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.11■□□□□ 0.97
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.11■□□□□ 0.97
TOP3B-206ENST00000436282 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.09■□□□□ 0.97
TOP3B-206ENST00000436282 FMN1Q68DA7 1419 aa21.07■□□□□ 0.96
TOP3B-206ENST00000436282 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.06■□□□□ 0.96
TOP3B-206ENST00000436282 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.06■□□□□ 0.96
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.05■□□□□ 0.96
TOP3B-206ENST00000436282 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.05■□□□□ 0.96
TOP3B-206ENST00000436282 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
TOP3B-206ENST00000436282 ANP32CO43423 234 aa21.02■□□□□ 0.96
TOP3B-206ENST00000436282 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 35.2
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM52Q96A61 297 aa20.98■□□□□ 0.95
TOP3B-206ENST00000436282 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.97■□□□□ 0.95
TOP3B-206ENST00000436282 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
TOP3B-206ENST00000436282 BCL11AQ9H165 835 aa20.96■□□□□ 0.95
TOP3B-206ENST00000436282 ARID3CA6NKF2 412 aa20.94■□□□□ 0.94
TOP3B-206ENST00000436282 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
TOP3B-206ENST00000436282 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.94■□□□□ 0.94
TOP3B-206ENST00000436282 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD9Q5K651 1589 aa20.9■□□□□ 0.94
TOP3B-206ENST00000436282 TONSLQ96HA7 1378 aa20.88■□□□□ 0.93
TOP3B-206ENST00000436282 GRIN2BQ13224 1484 aa20.87■□□□□ 0.93
TOP3B-206ENST00000436282 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.87■□□□□ 0.93
TOP3B-206ENST00000436282 NCOA2Q15596 1464 aa20.86■□□□□ 0.93
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRKQ15262 1439 aa20.83■□□□□ 0.93
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.83■□□□□ 0.93
TOP3B-206ENST00000436282 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.81■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.81■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 UACAQ9BZF9 1416 aa20.81■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.8■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 PBRM1Q86U86 1689 aa20.79■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 HFM1A2PYH4 1435 aa20.78■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.78■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.77■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 IQGAP2Q13576 1575 aa20.77■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 MSH5O43196 834 aa20.77■□□□□ 0.92
TOP3B-206ENST00000436282 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.77■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 ADAMTS12P58397 1594 aa20.76■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.75■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.75■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.73■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 IFT140Q96RY7 1462 aa20.71■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 NAIPQ13075 1403 aa20.7■□□□□ 0.91
TOP3B-206ENST00000436282 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TOP3B-206ENST00000436282 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.69■□□□□ 0.9
TOP3B-206ENST00000436282 FBLN2P98095 1184 aa20.69■□□□□ 0.9
TOP3B-206ENST00000436282 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.68■□□□□ 0.9
TOP3B-206ENST00000436282 HECW1Q76N89 1606 aa20.68■□□□□ 0.9
TOP3B-206ENST00000436282 ERCC6Q03468 1493 aa20.67■□□□□ 0.9
TOP3B-206ENST00000436282 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 WDR62O43379 1518 aa20.63■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF11O15085 1522 aa20.62■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.62■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.6■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.6■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.59■□□□□ 0.89
TOP3B-206ENST00000436282 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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