RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SPCS1-202ENST00000423431 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SPCS1-202ENST00000423431 CHD1O14646 1710 aa17.16■□□□□ 0.34
SPCS1-202ENST00000423431 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SPCS1-202ENST00000423431 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
SPCS1-202ENST00000423431 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
SPCS1-202ENST00000423431 TOPBP1Q92547 1522 aa17.06■□□□□ 0.32
SPCS1-202ENST00000423431 ATXN8OSP0DMR3 200 aa17.05■□□□□ 0.32
SPCS1-202ENST00000423431 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.02■□□□□ 0.32
SPCS1-202ENST00000423431 AKT1S1Q96B36 256 aa16.98■□□□□ 0.31
SPCS1-202ENST00000423431 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SPCS1-202ENST00000423431 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.93■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 ABCC8Q09428 1581 aa16.92■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 PRDM2Q13029 1718 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.91■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 SYNJ1O43426 1573 aa16.89■□□□□ 0.3
SPCS1-202ENST00000423431 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-202ENST00000423431 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.89■□□□□ 0.29
SPCS1-202ENST00000423431 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.86■□□□□ 0.29
SPCS1-202ENST00000423431 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-202ENST00000423431 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SPCS1-202ENST00000423431 SOGA1O94964 1423 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-202ENST00000423431 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.79■□□□□ 0.28
SPCS1-202ENST00000423431 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
SPCS1-202ENST00000423431 SYNJ2O15056 1496 aa16.73■□□□□ 0.27
SPCS1-202ENST00000423431 GRIN2BQ13224 1484 aa16.7■□□□□ 0.26
SPCS1-202ENST00000423431 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.68■□□□□ 0.26
SPCS1-202ENST00000423431 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.67■□□□□ 0.26
SPCS1-202ENST00000423431 PITPNM1O00562 1244 aa16.66■□□□□ 0.26
SPCS1-202ENST00000423431 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.64■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 PIP4P2Q8N4L2 257 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.63■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 SPDYE2BA6NHP3 402 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 SPDYE6P0CI01 402 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.62■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 WDR97A6NE52 1622 aa16.61■□□□□ 0.25
SPCS1-202ENST00000423431 KDM6BO15054 1643 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS1-202ENST00000423431 CEP170Q5SW79 1584 aa16.55■□□□□ 0.24
SPCS1-202ENST00000423431 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
SPCS1-202ENST00000423431 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-202ENST00000423431 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.52■□□□□ 0.24
SPCS1-202ENST00000423431 PBRM1Q86U86 1689 aa16.52■□□□□ 0.23
SPCS1-202ENST00000423431 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.51■□□□□ 0.23
SPCS1-202ENST00000423431 GRIN2AQ12879 1464 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-202ENST00000423431 HECW2Q9P2P5 1572 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-202ENST00000423431 CUX1P39880 1505 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 FBXO41Q8TF61 875 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 ADGRL1O94910 1474 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 NUP160Q12769 1436 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 DIP2BQ9P265 1576 aa16.42■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16.41■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 TSPOAP1O95153 1857 aa16.39■□□□□ 0.22
SPCS1-202ENST00000423431 SHROOM2Q13796 1616 aa16.38■□□□□ 0.21
SPCS1-202ENST00000423431 MAPKBP1O60336 1514 aa16.36■□□□□ 0.21
SPCS1-202ENST00000423431 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.36■□□□□ 0.21
SPCS1-202ENST00000423431 JPH4Q96JJ6 628 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-202ENST00000423431 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa16.35■□□□□ 0.21
SPCS1-202ENST00000423431 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-202ENST00000423431 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.34■□□□□ 0.21
SPCS1-202ENST00000423431 ADAMTS12P58397 1594 aa16.33■□□□□ 0.2
SPCS1-202ENST00000423431 HAX1O00165 279 aa16.32■□□□□ 0.2
SPCS1-202ENST00000423431 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-202ENST00000423431 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.29■□□□□ 0.2
SPCS1-202ENST00000423431 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-202ENST00000423431 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.26■□□□□ 0.19
SPCS1-202ENST00000423431 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SPCS1-202ENST00000423431 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SPCS1-202ENST00000423431 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
SPCS1-202ENST00000423431 EVX2Q03828 476 aa16.16■□□□□ 0.18
SPCS1-202ENST00000423431 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 SOCS7O14512 581 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 ILDR2Q71H61 639 aa16.13■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.11■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.1■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 ASXL2Q76L83 1435 aa16.09■□□□□ 0.17
SPCS1-202ENST00000423431 TOP2BQ02880 1626 aa16.08■□□□□ 0.16
SPCS1-202ENST00000423431 PTPRGP23470 1445 aa16.06■□□□□ 0.16
SPCS1-202ENST00000423431 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-202ENST00000423431 PRR29P0C7W0 189 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-202ENST00000423431 CHADLQ6NUI6 762 aa16.05■□□□□ 0.16
SPCS1-202ENST00000423431 GLI2P10070 1586 aa16.04■□□□□ 0.16
SPCS1-202ENST00000423431 ABCC2Q92887 1545 aa16.02■□□□□ 0.15
SPCS1-202ENST00000423431 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.02■□□□□ 0.15
SPCS1-202ENST00000423431 C19orf67A6NJJ6 358 aa15.99■□□□□ 0.15
SPCS1-202ENST00000423431 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.98■□□□□ 0.15
SPCS1-202ENST00000423431 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SPCS1-202ENST00000423431 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.94■□□□□ 0.14
SPCS1-202ENST00000423431 CUL7Q14999 1698 aa15.94■□□□□ 0.14
SPCS1-202ENST00000423431 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.93■□□□□ 0.14
SPCS1-202ENST00000423431 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.91■□□□□ 0.14
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