RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421101.1

LRRN3-202, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

TSL 2

Gene LRRN3, Length 1,830 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-202ENST00000421101 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.86□□□□□ -0.51
LRRN3-202ENST00000421101 GRIN2BQ13224 1484 aa11.86□□□□□ -0.51
LRRN3-202ENST00000421101 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
LRRN3-202ENST00000421101 CUL7Q14999 1698 aa11.82□□□□□ -0.52
LRRN3-202ENST00000421101 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.81□□□□□ -0.52
LRRN3-202ENST00000421101 PBRM1Q86U86 1689 aa11.8□□□□□ -0.52
LRRN3-202ENST00000421101 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.78□□□□□ -0.52
LRRN3-202ENST00000421101 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
LRRN3-202ENST00000421101 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
LRRN3-202ENST00000421101 CEP162Q5TB80 1403 aa11.77□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 FBLN2P98095 1184 aa11.76□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 ADAMTS12P58397 1594 aa11.75□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 SYNJ2O15056 1496 aa11.73□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 CLIP1P30622 1438 aa11.72□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 GRIN2AQ12879 1464 aa11.71□□□□□ -0.53
LRRN3-202ENST00000421101 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.65□□□□□ -0.54
LRRN3-202ENST00000421101 P3H3Q8IVL6 736 aa11.64□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.64□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.64□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 NUP160Q12769 1436 aa11.63□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 JPH4Q96JJ6 628 aa11.62□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 CEP170Q5SW79 1584 aa11.62□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 ARAP1Q96P48 1450 aa11.61□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 IQGAP2Q13576 1575 aa11.61□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.6□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 CHD1O14646 1710 aa11.59□□□□□ -0.55
LRRN3-202ENST00000421101 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.58□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.57□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.57□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.56□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 OSCARQ8IYS5 282 aa11.55□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 SAMD9Q5K651 1589 aa11.54□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 DISP1Q96F81 1524 aa11.54□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 APLP2Q06481 763 aa11.53□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
LRRN3-202ENST00000421101 FMN1Q68DA7 1419 aa11.51□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.51□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 KIAA0556O60303 1618 aa11.48□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.48□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.47□□□□□ -0.57
LRRN3-202ENST00000421101 SHROOM2Q13796 1616 aa11.46□□□□□ -0.58
LRRN3-202ENST00000421101 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
LRRN3-202ENST00000421101 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.44□□□□□ -0.58
LRRN3-202ENST00000421101 PTPRGP23470 1445 aa11.43□□□□□ -0.58
LRRN3-202ENST00000421101 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
LRRN3-202ENST00000421101 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.41□□□□□ -0.58
LRRN3-202ENST00000421101 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LRRN3-202ENST00000421101 MAP3K1Q13233 1512 aa11.4□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.4□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 ARID3CA6NKF2 412 aa11.39□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 TIAM1Q13009 1591 aa11.37□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.37□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.36□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 HECW1Q76N89 1606 aa11.35□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.35□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.35□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 UACAQ9BZF9 1416 aa11.35□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 ABCA8O94911 1581 aa11.34□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
LRRN3-202ENST00000421101 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.33□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.33□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 ATP10BO94823 1461 aa11.31□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.31□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 PLEKHD1A6NEE1 506 aa11.3□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.28□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 ARHGEF11O15085 1522 aa11.28□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.28□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 ABCC2Q92887 1545 aa11.28□□□□□ -0.6
LRRN3-202ENST00000421101 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.27□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.26□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.25□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 NCOA2Q15596 1464 aa11.24□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.23□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.22□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.21□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
LRRN3-202ENST00000421101 KCNH8Q96L42 1107 aa11.21□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.2□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.2□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.2□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.19□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.18□□□□□ -0.62
LRRN3-202ENST00000421101 ITGAEP38570 1179 aa11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms