RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404914.7

ATG4B-205, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4B, Length 2,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-205ENST00000404914 ITGAEP38570 1179 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-205ENST00000404914 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
ATG4B-205ENST00000404914 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4B-205ENST00000404914 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4B-205ENST00000404914 PRXQ9BXM0 1461 aa22.32■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 WDR62O43379 1518 aa22.31■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 CUX2O14529 1486 aa22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 FKBP8Q14318 412 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.28■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 MAPKBP1O60336 1514 aa22.27■■□□□ 1.16
ATG4B-205ENST00000404914 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-205ENST00000404914 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG4B-205ENST00000404914 BCL11AQ9H165 835 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG4B-205ENST00000404914 WDR97A6NE52 1622 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG4B-205ENST00000404914 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-205ENST00000404914 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-205ENST00000404914 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-205ENST00000404914 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
ATG4B-205ENST00000404914 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-205ENST00000404914 TRIM52Q96A61 297 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-205ENST00000404914 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-205ENST00000404914 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-205ENST00000404914 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG4B-205ENST00000404914 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
ATG4B-205ENST00000404914 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-205ENST00000404914 IFT140Q96RY7 1462 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-205ENST00000404914 KIF27Q86VH2 1401 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG4B-205ENST00000404914 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.123e-7■■■■□ 19.9
ATG4B-205ENST00000404914 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22■■□□□ 1.11
ATG4B-205ENST00000404914 TIAM1Q13009 1591 aa21.99■■□□□ 1.11
ATG4B-205ENST00000404914 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-205ENST00000404914 MSH5O43196 834 aa21.98■■□□□ 1.11
ATG4B-205ENST00000404914 NEFLP07196 543 aa21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-205ENST00000404914 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
ATG4B-205ENST00000404914 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ATG4B-205ENST00000404914 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.94■■□□□ 1.1
ATG4B-205ENST00000404914 IGF1RP08069 1367 aa21.92■■□□□ 1.1
ATG4B-205ENST00000404914 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.91■■□□□ 1.1
ATG4B-205ENST00000404914 CCER2I3L3R5 266 aa21.89■■□□□ 1.09
ATG4B-205ENST00000404914 ANP32CO43423 234 aa21.89■■□□□ 1.09
ATG4B-205ENST00000404914 PBRM1Q86U86 1689 aa21.88■■□□□ 1.09
ATG4B-205ENST00000404914 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ATG4B-205ENST00000404914 P3H3Q8IVL6 736 aa21.84■■□□□ 1.09
ATG4B-205ENST00000404914 MAP3K1Q13233 1512 aa21.83■■□□□ 1.08
ATG4B-205ENST00000404914 GRIN2BQ13224 1484 aa21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-205ENST00000404914 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
ATG4B-205ENST00000404914 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.78■■□□□ 1.08
ATG4B-205ENST00000404914 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-205ENST00000404914 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ATG4B-205ENST00000404914 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.75■■□□□ 1.07
ATG4B-205ENST00000404914 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.74■■□□□ 1.07
ATG4B-205ENST00000404914 CUL7Q14999 1698 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-205ENST00000404914 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-205ENST00000404914 ADAMTS12P58397 1594 aa21.72■■□□□ 1.07
ATG4B-205ENST00000404914 TONSLQ96HA7 1378 aa21.69■■□□□ 1.06
ATG4B-205ENST00000404914 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.67■■□□□ 1.06
ATG4B-205ENST00000404914 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-205ENST00000404914 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-205ENST00000404914 FBLN2P98095 1184 aa21.65■■□□□ 1.06
ATG4B-205ENST00000404914 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
ATG4B-205ENST00000404914 PTPRKQ15262 1439 aa21.63■■□□□ 1.05
ATG4B-205ENST00000404914 CCDC184Q52MB2 194 aa21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-205ENST00000404914 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ATG4B-205ENST00000404914 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.61■■□□□ 1.05
ATG4B-205ENST00000404914 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.6■■□□□ 1.05
ATG4B-205ENST00000404914 SYNJ2O15056 1496 aa21.59■■□□□ 1.05
ATG4B-205ENST00000404914 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
ATG4B-205ENST00000404914 CHD1O14646 1710 aa21.58■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 GRIN2AQ12879 1464 aa21.57■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.56■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 UACAQ9BZF9 1416 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.53■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.045e-9■■■■□ 24.7
ATG4B-205ENST00000404914 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.52■■□□□ 1.04
ATG4B-205ENST00000404914 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 CEP170Q5SW79 1584 aa21.5■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 HFM1A2PYH4 1435 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.49■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 NAIPQ13075 1403 aa21.47■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.46■■□□□ 1.03
ATG4B-205ENST00000404914 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ATG4B-205ENST00000404914 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.43■■□□□ 1.02
ATG4B-205ENST00000404914 NUP160Q12769 1436 aa21.42■■□□□ 1.02
ATG4B-205ENST00000404914 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-205ENST00000404914 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ATG4B-205ENST00000404914 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.4■■□□□ 1.02
ATG4B-205ENST00000404914 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-205ENST00000404914 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-205ENST00000404914 NCOA2Q15596 1464 aa21.38■■□□□ 1.01
ATG4B-205ENST00000404914 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-205ENST00000404914 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.37■■□□□ 1.01
ATG4B-205ENST00000404914 IQGAP2Q13576 1575 aa21.36■■□□□ 1.01
ATG4B-205ENST00000404914 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.36■■□□□ 1.01
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