RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398333.7

C15orf38-AP3S2-201, Transcript of C15orf38-AP3S2 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C15orf38-AP3S2, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 WDR62O43379 1518 aa24.17■■□□□ 1.46
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PRXQ9BXM0 1461 aa24.17■■□□□ 1.46
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 KCNH8Q96L42 1107 aa24.16■■□□□ 1.46
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.11■■□□□ 1.45
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 BCL11AQ9H165 835 aa24.1■■□□□ 1.45
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.08■■□□□ 1.45
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MAPKBP1O60336 1514 aa24.08■■□□□ 1.44
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FKBP8Q14318 412 aa24.02■■□□□ 1.44
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 BCANQ96GW7 911 aa24.01■■□□□ 1.43
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.98■■□□□ 1.43
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.96■■□□□ 1.43
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 KIF27Q86VH2 1401 aa23.95■■□□□ 1.43
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.93■■□□□ 1.42
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 WDR97A6NE52 1622 aa23.93■■□□□ 1.42
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 IFT140Q96RY7 1462 aa23.91■■□□□ 1.42
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.9■■□□□ 1.42
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.85■■□□□ 1.41
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ITGAEP38570 1179 aa23.84■■□□□ 1.41
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MAP3K1Q13233 1512 aa23.84■■□□□ 1.41
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CCER2I3L3R5 266 aa23.83■■□□□ 1.41
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NEFLP07196 543 aa23.83■■□□□ 1.41
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 IGF1RP08069 1367 aa23.82■■□□□ 1.4
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TIAM1Q13009 1591 aa23.81■■□□□ 1.4
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.78■■□□□ 1.4
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.75■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.75■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.72■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MSH5O43196 834 aa23.71■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TRIM52Q96A61 297 aa23.71■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.7■■□□□ 1.38
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.68■■□□□ 1.38
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ANP32CO43423 234 aa23.68■■□□□ 1.38
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.67■■□□□ 1.38
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PBRM1Q86U86 1689 aa23.64■■□□□ 1.37
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.63■■□□□ 1.37
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GRIN2BQ13224 1484 aa23.62■■□□□ 1.37
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.61■■□□□ 1.37
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.49■■□□□ 1.35
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TONSLQ96HA7 1378 aa23.42■■□□□ 1.34
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.41■■□□□ 1.34
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SYNJ2O15056 1496 aa23.39■■□□□ 1.34
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
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C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.35■■□□□ 1.33
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.34■■□□□ 1.33
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FBLN2P98095 1184 aa23.34■■□□□ 1.33
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.34■■□□□ 1.33
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 UACAQ9BZF9 1416 aa23.34■■□□□ 1.33
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GRIN2AQ12879 1464 aa23.32■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.32■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 HFM1A2PYH4 1435 aa23.31■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.3■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.3■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.3■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.3■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.29■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CHD1O14646 1710 aa23.28■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.27■■□□□ 1.32
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PTPRKQ15262 1439 aa23.26■■□□□ 1.31
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.25■■□□□ 1.31
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.23■■□□□ 1.31
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NCOA2Q15596 1464 aa23.23■■□□□ 1.31
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NAIPQ13075 1403 aa23.2■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CEP170Q5SW79 1584 aa23.18■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NUP160Q12769 1436 aa23.17■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.15■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CCDC184Q52MB2 194 aa23.14■■□□□ 1.3
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.12■■□□□ 1.29
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 IQGAP2Q13576 1575 aa23.11■■□□□ 1.29
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.1■■□□□ 1.29
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FMN1Q68DA7 1419 aa23.1■■□□□ 1.29
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.1■■□□□ 1.29
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.08■■□□□ 1.29
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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