RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396352.8

HOXA3-202, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA3, Length 3,263 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-202ENST00000396352 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.83■■□□□ 1.25
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HOXA3-202ENST00000396352 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.8■■□□□ 1.24
HOXA3-202ENST00000396352 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXA3-202ENST00000396352 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXA3-202ENST00000396352 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.76■■□□□ 1.23
HOXA3-202ENST00000396352 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXA3-202ENST00000396352 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXA3-202ENST00000396352 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXA3-202ENST00000396352 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.71■■□□□ 1.23
HOXA3-202ENST00000396352 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.7■■□□□ 1.22
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HOXA3-202ENST00000396352 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
HOXA3-202ENST00000396352 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXA3-202ENST00000396352 TOPBP1Q92547 1522 aa22.69■■□□□ 1.22
HOXA3-202ENST00000396352 WDR97A6NE52 1622 aa22.68■■□□□ 1.22
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HOXA3-202ENST00000396352 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.66■■□□□ 1.22
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HOXA3-202ENST00000396352 NESP48681 1621 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXA3-202ENST00000396352 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXA3-202ENST00000396352 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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HOXA3-202ENST00000396352 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.53■■□□□ 1.2
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HOXA3-202ENST00000396352 PTPRKQ15262 1439 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXA3-202ENST00000396352 HFM1A2PYH4 1435 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXA3-202ENST00000396352 GRIN2BQ13224 1484 aa22.41■■□□□ 1.18
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HOXA3-202ENST00000396352 UACAQ9BZF9 1416 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA3-202ENST00000396352 NCOA2Q15596 1464 aa22.37■■□□□ 1.17
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HOXA3-202ENST00000396352 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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HOXA3-202ENST00000396352 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXA3-202ENST00000396352 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXA3-202ENST00000396352 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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HOXA3-202ENST00000396352 FKBP8Q14318 412 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA3-202ENST00000396352 KDM6BO15054 1643 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA3-202ENST00000396352 IQGAP2Q13576 1575 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXA3-202ENST00000396352 AKNAQ7Z591 1439 aa22.13■■□□□ 1.13
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HOXA3-202ENST00000396352 BCANQ96GW7 911 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXA3-202ENST00000396352 TRIM52Q96A61 297 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA3-202ENST00000396352 ADAMTS12P58397 1594 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXA3-202ENST00000396352 WDR62O43379 1518 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXA3-202ENST00000396352 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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HOXA3-202ENST00000396352 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXA3-202ENST00000396352 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22■■□□□ 1.11
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HOXA3-202ENST00000396352 KIAA0556O60303 1618 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXA3-202ENST00000396352 ROCK1Q13464 1354 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXA3-202ENST00000396352 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXA3-202ENST00000396352 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
HOXA3-202ENST00000396352 DISP1Q96F81 1524 aa21.89■■□□□ 1.1
HOXA3-202ENST00000396352 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXA3-202ENST00000396352 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
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HOXA3-202ENST00000396352 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.88■■□□□ 1.09
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