RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.05■■■■□ 3.52
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C9orf40-201ENST00000376854 TIAM1Q13009 1591 aa37.02■■■■□ 3.52
C9orf40-201ENST00000376854 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.01■■■■□ 3.51
C9orf40-201ENST00000376854 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
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C9orf40-201ENST00000376854 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa36.89■■■■□ 3.5
C9orf40-201ENST00000376854 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.87■■■■□ 3.49
C9orf40-201ENST00000376854 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.85■■■■□ 3.49
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C9orf40-201ENST00000376854 WDR97A6NE52 1622 aa36.83■■■■□ 3.49
C9orf40-201ENST00000376854 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
C9orf40-201ENST00000376854 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.81■■■■□ 3.48
C9orf40-201ENST00000376854 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.79■■■■□ 3.48
C9orf40-201ENST00000376854 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
C9orf40-201ENST00000376854 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.77■■■■□ 3.48
C9orf40-201ENST00000376854 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
C9orf40-201ENST00000376854 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.73■■■■□ 3.47
C9orf40-201ENST00000376854 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.72■■■■□ 3.47
C9orf40-201ENST00000376854 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.71■■■■□ 3.47
C9orf40-201ENST00000376854 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.71■■■■□ 3.47
C9orf40-201ENST00000376854 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf40-201ENST00000376854 MAPKBP1O60336 1514 aa36.7■■■■□ 3.47
C9orf40-201ENST00000376854 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.68■■■■□ 3.46
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C9orf40-201ENST00000376854 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.65■■■■□ 3.46
C9orf40-201ENST00000376854 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.61■■■■□ 3.45
C9orf40-201ENST00000376854 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.58■■■■□ 3.45
C9orf40-201ENST00000376854 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.54■■■■□ 3.44
C9orf40-201ENST00000376854 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
C9orf40-201ENST00000376854 FMN1Q68DA7 1419 aa36.45■■■■□ 3.43
C9orf40-201ENST00000376854 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.45■■■■□ 3.43
C9orf40-201ENST00000376854 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.43■■■■□ 3.42
C9orf40-201ENST00000376854 SAMD9Q5K651 1589 aa36.42■■■■□ 3.42
C9orf40-201ENST00000376854 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.4■■■■□ 3.42
C9orf40-201ENST00000376854 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.3■■■■□ 3.4
C9orf40-201ENST00000376854 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.3■■■■□ 3.4
C9orf40-201ENST00000376854 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.29■■■■□ 3.4
C9orf40-201ENST00000376854 PBRM1Q86U86 1689 aa36.27■■■■□ 3.4
C9orf40-201ENST00000376854 MTUS2Q5JR59 1369 aa36.26■■■■□ 3.39
C9orf40-201ENST00000376854 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.25■■■■□ 3.39
C9orf40-201ENST00000376854 GRIN2BQ13224 1484 aa36.25■■■■□ 3.39
C9orf40-201ENST00000376854 ADAMTS12P58397 1594 aa36.15■■■■□ 3.38
C9orf40-201ENST00000376854 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 KCNH8Q96L42 1107 aa36.1■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 NCOA2Q15596 1464 aa36.1■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.1■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
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C9orf40-201ENST00000376854 PTPRKQ15262 1439 aa36.09■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
C9orf40-201ENST00000376854 IQGAP2Q13576 1575 aa36.07■■■■□ 3.36
C9orf40-201ENST00000376854 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.06■■■■□ 3.36
C9orf40-201ENST00000376854 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.03■■■■□ 3.36
C9orf40-201ENST00000376854 UACAQ9BZF9 1416 aa36.02■■■■□ 3.36
C9orf40-201ENST00000376854 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.01■■■■□ 3.36
C9orf40-201ENST00000376854 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa36.01■■■■□ 3.36
C9orf40-201ENST00000376854 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
C9orf40-201ENST00000376854 IFT140Q96RY7 1462 aa35.98■■■■□ 3.35
C9orf40-201ENST00000376854 TONSLQ96HA7 1378 aa35.98■■■■□ 3.35
C9orf40-201ENST00000376854 WDR62O43379 1518 aa35.97■■■■□ 3.35
C9orf40-201ENST00000376854 NAIPQ13075 1403 aa35.96■■■■□ 3.35
C9orf40-201ENST00000376854 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
C9orf40-201ENST00000376854 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.93■■■■□ 3.34
C9orf40-201ENST00000376854 HECW1Q76N89 1606 aa35.91■■■■□ 3.34
C9orf40-201ENST00000376854 ARHGEF11O15085 1522 aa35.9■■■■□ 3.34
C9orf40-201ENST00000376854 ARID3CA6NKF2 412 aa35.88■■■■□ 3.33
C9orf40-201ENST00000376854 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
C9orf40-201ENST00000376854 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
C9orf40-201ENST00000376854 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
C9orf40-201ENST00000376854 ANP32CO43423 234 aa35.77■■■■□ 3.32
C9orf40-201ENST00000376854 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
C9orf40-201ENST00000376854 CCER2I3L3R5 266 aa35.75■■■■□ 3.31
C9orf40-201ENST00000376854 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.74■■■■□ 3.31
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C9orf40-201ENST00000376854 DISP1Q96F81 1524 aa35.73■■■■□ 3.31
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C9orf40-201ENST00000376854 KIAA0556O60303 1618 aa35.7■■■■□ 3.3
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C9orf40-201ENST00000376854 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.66■■■■□ 3.3
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C9orf40-201ENST00000376854 MYT1Q01538 1121 aa35.61■■■■□ 3.29
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C9orf40-201ENST00000376854 KDM6BO15054 1643 aa35.53■■■■□ 3.28
C9orf40-201ENST00000376854 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
C9orf40-201ENST00000376854 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
C9orf40-201ENST00000376854 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.51■■■■□ 3.28
C9orf40-201ENST00000376854 CEP170Q5SW79 1584 aa35.51■■■■□ 3.28
C9orf40-201ENST00000376854 FBLN2P98095 1184 aa35.49■■■■□ 3.27
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C9orf40-201ENST00000376854 SYNJ2O15056 1496 aa35.47■■■■□ 3.27
C9orf40-201ENST00000376854 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.47■■■■□ 3.27
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