RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368815.6

EDRF1-205, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EDRF1, Length 4,123 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-205ENST00000368815 ITGAEP38570 1179 aa16.18■□□□□ 0.18
EDRF1-205ENST00000368815 ARID3CA6NKF2 412 aa16.17■□□□□ 0.18
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EDRF1-205ENST00000368815 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.14■□□□□ 0.17
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EDRF1-205ENST00000368815 EEA1Q15075 1411 aa16.13■□□□□ 0.17
EDRF1-205ENST00000368815 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.13■□□□□ 0.17
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EDRF1-205ENST00000368815 HECW1Q76N89 1606 aa15.34■□□□□ 0.05
EDRF1-205ENST00000368815 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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EDRF1-205ENST00000368815 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
EDRF1-205ENST00000368815 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.044e-7■■□□□ 14
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