RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 KCNH8Q96L42 1107 aa27.16■■□□□ 1.94
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CITED2-201ENST00000367651 MYT1Q01538 1121 aa27.12■■□□□ 1.93
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CITED2-201ENST00000367651 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.83■■□□□ 1.89
CITED2-201ENST00000367651 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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CITED2-201ENST00000367651 CUL7Q14999 1698 aa26.74■■□□□ 1.87
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CITED2-201ENST00000367651 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.7■■□□□ 1.86
CITED2-201ENST00000367651 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.7■■□□□ 1.86
CITED2-201ENST00000367651 FKBP8Q14318 412 aa26.68■■□□□ 1.86
CITED2-201ENST00000367651 FMN1Q68DA7 1419 aa26.65■■□□□ 1.86
CITED2-201ENST00000367651 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.65■■□□□ 1.86
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CITED2-201ENST00000367651 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.62■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 TONSLQ96HA7 1378 aa26.62■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 TRIM52Q96A61 297 aa26.61■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.61■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 CCER2I3L3R5 266 aa26.6■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 SAMD9Q5K651 1589 aa26.6■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 UACAQ9BZF9 1416 aa26.6■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 ANP32CO43423 234 aa26.58■■□□□ 1.85
CITED2-201ENST00000367651 NCOA2Q15596 1464 aa26.57■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 NAIPQ13075 1403 aa26.56■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.55■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 GRIN2BQ13224 1484 aa26.54■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.53■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.52■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CITED2-201ENST00000367651 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.5■■□□□ 1.83
CITED2-201ENST00000367651 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CITED2-201ENST00000367651 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.47■■□□□ 1.83
CITED2-201ENST00000367651 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.44■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.43■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.43■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 NEFLP07196 543 aa26.41■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 ARHGEF11O15085 1522 aa26.41■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.4■■□□□ 1.82
CITED2-201ENST00000367651 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.38■■□□□ 1.81
CITED2-201ENST00000367651 KDM6BO15054 1643 aa26.36■■□□□ 1.81
CITED2-201ENST00000367651 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.35■■□□□ 1.81
CITED2-201ENST00000367651 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.35■■□□□ 1.81
CITED2-201ENST00000367651 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.34■■□□□ 1.81
CITED2-201ENST00000367651 HECW1Q76N89 1606 aa26.31■■□□□ 1.8
CITED2-201ENST00000367651 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.31■■□□□ 1.8
CITED2-201ENST00000367651 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CITED2-201ENST00000367651 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CITED2-201ENST00000367651 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CITED2-201ENST00000367651 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
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CITED2-201ENST00000367651 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CITED2-201ENST00000367651 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CITED2-201ENST00000367651 AKNAQ7Z591 1439 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 FOXD1Q16676 465 aa26.19■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 ARID3CA6NKF2 412 aa26.18■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 CCDC184Q52MB2 194 aa26.17■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.16■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 PBRM1Q86U86 1689 aa26.16■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 IQGAP2Q13576 1575 aa26.14■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.14■■□□□ 1.78
CITED2-201ENST00000367651 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.13■■□□□ 1.77
CITED2-201ENST00000367651 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
CITED2-201ENST00000367651 WDR62O43379 1518 aa26.13■■□□□ 1.77
CITED2-201ENST00000367651 MIA2Q96PC5 1412 aa26.11■■□□□ 1.77
CITED2-201ENST00000367651 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
CITED2-201ENST00000367651 ADAMTS12P58397 1594 aa26.08■■□□□ 1.77
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