RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356462.10

NEDD4L-202, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4L, Length 3,335 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-202ENST00000356462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NEDD4L-202ENST00000356462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.37■■□□□ 1.17
NEDD4L-202ENST00000356462 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD4L-202ENST00000356462 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NEDD4L-202ENST00000356462 TOPBP1Q92547 1522 aa22.34■■□□□ 1.17
NEDD4L-202ENST00000356462 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEDD4L-202ENST00000356462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.31■■□□□ 1.16
NEDD4L-202ENST00000356462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.27■■□□□ 1.16
NEDD4L-202ENST00000356462 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.26■■□□□ 1.15
NEDD4L-202ENST00000356462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.25■■□□□ 1.15
NEDD4L-202ENST00000356462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.153e-8■■■■□ 24.8
NEDD4L-202ENST00000356462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NEDD4L-202ENST00000356462 TRIM52Q96A61 297 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD4L-202ENST00000356462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD4L-202ENST00000356462 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD4L-202ENST00000356462 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD4L-202ENST00000356462 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NEDD4L-202ENST00000356462 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 KCNH8Q96L42 1107 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 FOXD1Q16676 465 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD4L-202ENST00000356462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD4L-202ENST00000356462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD4L-202ENST00000356462 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD4L-202ENST00000356462 TIAM1Q13009 1591 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD4L-202ENST00000356462 ERCC6Q03468 1493 aa22■■□□□ 1.11
NEDD4L-202ENST00000356462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NEDD4L-202ENST00000356462 PRDM2Q13029 1718 aa21.96■■□□□ 1.11
NEDD4L-202ENST00000356462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.94■■□□□ 1.1
NEDD4L-202ENST00000356462 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
NEDD4L-202ENST00000356462 FMN1Q68DA7 1419 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD4L-202ENST00000356462 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.93■■□□□ 1.1
NEDD4L-202ENST00000356462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.92■■□□□ 1.1
NEDD4L-202ENST00000356462 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
NEDD4L-202ENST00000356462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.89■■□□□ 1.09
NEDD4L-202ENST00000356462 TONSLQ96HA7 1378 aa21.88■■□□□ 1.09
NEDD4L-202ENST00000356462 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.86■■□□□ 1.09
NEDD4L-202ENST00000356462 BCANQ96GW7 911 aa21.85■■□□□ 1.09
NEDD4L-202ENST00000356462 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.84■■□□□ 1.09
NEDD4L-202ENST00000356462 PTPRKQ15262 1439 aa21.83■■□□□ 1.09
NEDD4L-202ENST00000356462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NEDD4L-202ENST00000356462 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD4L-202ENST00000356462 NCOA2Q15596 1464 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD4L-202ENST00000356462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.8■■□□□ 1.08
NEDD4L-202ENST00000356462 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 MAPKBP1O60336 1514 aa21.75■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.74■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 WDR97A6NE52 1622 aa21.73■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 CUL7Q14999 1698 aa21.72■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 JPH4Q96JJ6 628 aa21.72■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.71■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.71■■□□□ 1.07
NEDD4L-202ENST00000356462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.69■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.69■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 GRIN2BQ13224 1484 aa21.68■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.67■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.66■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.65■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 ANP32CO43423 234 aa21.65■■□□□ 1.06
NEDD4L-202ENST00000356462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.63■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.61■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 MAP3K1Q13233 1512 aa21.6■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.058e-7■■■□□ 14.8
NEDD4L-202ENST00000356462 NAIPQ13075 1403 aa21.59■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 IQGAP2Q13576 1575 aa21.58■■□□□ 1.05
NEDD4L-202ENST00000356462 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.58■■□□□ 1.04
NEDD4L-202ENST00000356462 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.57■■□□□ 1.04
NEDD4L-202ENST00000356462 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.047e-7■■■■□ 23.1
NEDD4L-202ENST00000356462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NEDD4L-202ENST00000356462 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
NEDD4L-202ENST00000356462 IFT140Q96RY7 1462 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD4L-202ENST00000356462 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD4L-202ENST00000356462 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 HFM1A2PYH4 1435 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 UACAQ9BZF9 1416 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 FKBP8Q14318 412 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 PBRM1Q86U86 1689 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 RGL3Q3MIN7 710 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 SAMD9Q5K651 1589 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 GRIN2AQ12879 1464 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 PKD2Q13563 968 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 ADAMTS12P58397 1594 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
NEDD4L-202ENST00000356462 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.022e-6■■■■□ 20.4
NEDD4L-202ENST00000356462 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
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