RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355285.9

APCDD1-201, Transcript of APC down-regulated 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APCDD1, Length 3,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1-201ENST00000355285 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.76■■□□□ 1.71
APCDD1-201ENST00000355285 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.75■■□□□ 1.71
APCDD1-201ENST00000355285 CFTRP13569 1480 aa25.71■■□□□ 1.71
APCDD1-201ENST00000355285 CUX1P39880 1505 aa25.71■■□□□ 1.71
APCDD1-201ENST00000355285 BCANQ96GW7 911 aa25.67■■□□□ 1.7
APCDD1-201ENST00000355285 KIF21BO75037 1637 aa25.65■■□□□ 1.7
APCDD1-201ENST00000355285 TONSLQ96HA7 1378 aa25.63■■□□□ 1.69
APCDD1-201ENST00000355285 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.63■■□□□ 1.69
APCDD1-201ENST00000355285 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
APCDD1-201ENST00000355285 ARAP1Q96P48 1450 aa25.62■■□□□ 1.69
APCDD1-201ENST00000355285 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.6■■□□□ 1.69
APCDD1-201ENST00000355285 ERCC6Q03468 1493 aa25.59■■□□□ 1.69
APCDD1-201ENST00000355285 NEFLP07196 543 aa25.58■■□□□ 1.68
APCDD1-201ENST00000355285 TOP2BQ02880 1626 aa25.57■■□□□ 1.68
APCDD1-201ENST00000355285 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.56■■□□□ 1.68
APCDD1-201ENST00000355285 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.54■■□□□ 1.68
APCDD1-201ENST00000355285 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.53■■□□□ 1.68
APCDD1-201ENST00000355285 ANP32CO43423 234 aa25.53■■□□□ 1.68
APCDD1-201ENST00000355285 PRXQ9BXM0 1461 aa25.51■■□□□ 1.67
APCDD1-201ENST00000355285 HMGXB3Q12766 1538 aa25.51■■□□□ 1.67
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APCDD1-201ENST00000355285 KCNH8Q96L42 1107 aa25.46■■□□□ 1.67
APCDD1-201ENST00000355285 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.45■■□□□ 1.66
APCDD1-201ENST00000355285 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
APCDD1-201ENST00000355285 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
APCDD1-201ENST00000355285 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
APCDD1-201ENST00000355285 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
APCDD1-201ENST00000355285 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.39■■□□□ 1.66
APCDD1-201ENST00000355285 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
APCDD1-201ENST00000355285 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.38■■□□□ 1.65
APCDD1-201ENST00000355285 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.37■■□□□ 1.65
APCDD1-201ENST00000355285 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.36■■□□□ 1.65
APCDD1-201ENST00000355285 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
APCDD1-201ENST00000355285 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.32■■□□□ 1.64
APCDD1-201ENST00000355285 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.32■■□□□ 1.64
APCDD1-201ENST00000355285 TOPBP1Q92547 1522 aa25.29■■□□□ 1.64
APCDD1-201ENST00000355285 TSPY4P0CV99 314 aa25.27■■□□□ 1.64
APCDD1-201ENST00000355285 TSPY10P0CW01 314 aa25.27■■□□□ 1.64
APCDD1-201ENST00000355285 FMN1Q68DA7 1419 aa25.27■■□□□ 1.64
APCDD1-201ENST00000355285 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.25■■□□□ 1.63
APCDD1-201ENST00000355285 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.24■■□□□ 1.63
APCDD1-201ENST00000355285 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.21■■□□□ 1.63
APCDD1-201ENST00000355285 RGL3Q3MIN7 710 aa25.19■■□□□ 1.62
APCDD1-201ENST00000355285 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
APCDD1-201ENST00000355285 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
APCDD1-201ENST00000355285 MYT1Q01538 1121 aa25.17■■□□□ 1.62
APCDD1-201ENST00000355285 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
APCDD1-201ENST00000355285 JPH4Q96JJ6 628 aa25.14■■□□□ 1.62
APCDD1-201ENST00000355285 FKBP8Q14318 412 aa25.14■■□□□ 1.61
APCDD1-201ENST00000355285 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.13■■□□□ 1.61
APCDD1-201ENST00000355285 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
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APCDD1-201ENST00000355285 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
APCDD1-201ENST00000355285 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
APCDD1-201ENST00000355285 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.06■■□□□ 1.6
APCDD1-201ENST00000355285 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.05■■□□□ 1.6
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APCDD1-201ENST00000355285 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.96■■□□□ 1.59
APCDD1-201ENST00000355285 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.95■■□□□ 1.59
APCDD1-201ENST00000355285 PKD2Q13563 968 aa24.95■■□□□ 1.58
APCDD1-201ENST00000355285 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
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APCDD1-201ENST00000355285 TIAM1Q13009 1591 aa24.89■■□□□ 1.57
APCDD1-201ENST00000355285 NCOA2Q15596 1464 aa24.87■■□□□ 1.57
APCDD1-201ENST00000355285 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.87■■□□□ 1.57
APCDD1-201ENST00000355285 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.86■■□□□ 1.57
APCDD1-201ENST00000355285 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.86■■□□□ 1.57
APCDD1-201ENST00000355285 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
APCDD1-201ENST00000355285 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
APCDD1-201ENST00000355285 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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APCDD1-201ENST00000355285 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.83■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.82■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 GRIN2BQ13224 1484 aa24.8■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.79■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 NUP155O75694 1391 aa24.78■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.78■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.78■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 TMC1Q8TDI8 760 aa24.77■■□□□ 1.56
APCDD1-201ENST00000355285 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.76■■□□□ 1.55
APCDD1-201ENST00000355285 PRDM2Q13029 1718 aa24.76■■□□□ 1.55
APCDD1-201ENST00000355285 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
APCDD1-201ENST00000355285 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
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APCDD1-201ENST00000355285 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.73■■□□□ 1.55
APCDD1-201ENST00000355285 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
APCDD1-201ENST00000355285 PTPRGP23470 1445 aa24.67■■□□□ 1.54
APCDD1-201ENST00000355285 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.64■■□□□ 1.53
APCDD1-201ENST00000355285 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.61■■□□□ 1.53
APCDD1-201ENST00000355285 UACAQ9BZF9 1416 aa24.59■■□□□ 1.53
APCDD1-201ENST00000355285 IFT140Q96RY7 1462 aa24.58■■□□□ 1.53
APCDD1-201ENST00000355285 WDR97A6NE52 1622 aa24.58■■□□□ 1.52
APCDD1-201ENST00000355285 PTPRKQ15262 1439 aa24.57■■□□□ 1.52
APCDD1-201ENST00000355285 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.55■■□□□ 1.52
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