RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.07■■□□□ 1.44
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GDE1-201ENST00000353258 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
GDE1-201ENST00000353258 P3H3Q8IVL6 736 aa24.02■■□□□ 1.44
GDE1-201ENST00000353258 ITGAEP38570 1179 aa23.99■■□□□ 1.43
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GDE1-201ENST00000353258 TOPBP1Q92547 1522 aa23.98■■□□□ 1.43
GDE1-201ENST00000353258 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.98■■□□□ 1.43
GDE1-201ENST00000353258 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GDE1-201ENST00000353258 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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GDE1-201ENST00000353258 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.89■■□□□ 1.41
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GDE1-201ENST00000353258 MSH5O43196 834 aa23.86■■□□□ 1.41
GDE1-201ENST00000353258 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
GDE1-201ENST00000353258 TIAM1Q13009 1591 aa23.84■■□□□ 1.41
GDE1-201ENST00000353258 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.82■■□□□ 1.4
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GDE1-201ENST00000353258 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
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GDE1-201ENST00000353258 CUL7Q14999 1698 aa23.71■■□□□ 1.39
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GDE1-201ENST00000353258 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.67■■□□□ 1.38
GDE1-201ENST00000353258 WDR97A6NE52 1622 aa23.67■■□□□ 1.38
GDE1-201ENST00000353258 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.67■■□□□ 1.38
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GDE1-201ENST00000353258 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.65■■□□□ 1.38
GDE1-201ENST00000353258 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.64■■□□□ 1.38
GDE1-201ENST00000353258 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.64■■□□□ 1.37
GDE1-201ENST00000353258 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.62■■□□□ 1.37
GDE1-201ENST00000353258 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.61■■□□□ 1.37
GDE1-201ENST00000353258 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.59■■□□□ 1.37
GDE1-201ENST00000353258 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.58■■□□□ 1.37
GDE1-201ENST00000353258 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
GDE1-201ENST00000353258 MAPKBP1O60336 1514 aa23.54■■□□□ 1.36
GDE1-201ENST00000353258 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.54■■□□□ 1.36
GDE1-201ENST00000353258 FMN1Q68DA7 1419 aa23.53■■□□□ 1.36
GDE1-201ENST00000353258 CCER2I3L3R5 266 aa23.52■■□□□ 1.36
GDE1-201ENST00000353258 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
GDE1-201ENST00000353258 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
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GDE1-201ENST00000353258 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
GDE1-201ENST00000353258 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.47■■□□□ 1.35
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GDE1-201ENST00000353258 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.45■■□□□ 1.34
GDE1-201ENST00000353258 SAMD9Q5K651 1589 aa23.44■■□□□ 1.34
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GDE1-201ENST00000353258 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.39■■□□□ 1.33
GDE1-201ENST00000353258 PBRM1Q86U86 1689 aa23.37■■□□□ 1.33
GDE1-201ENST00000353258 ARID3CA6NKF2 412 aa23.37■■□□□ 1.33
GDE1-201ENST00000353258 GRIN2BQ13224 1484 aa23.35■■□□□ 1.33
GDE1-201ENST00000353258 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.34■■□□□ 1.33
GDE1-201ENST00000353258 NCOA2Q15596 1464 aa23.32■■□□□ 1.32
GDE1-201ENST00000353258 PTPRKQ15262 1439 aa23.29■■□□□ 1.32
GDE1-201ENST00000353258 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
GDE1-201ENST00000353258 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
GDE1-201ENST00000353258 ADAMTS12P58397 1594 aa23.27■■□□□ 1.32
GDE1-201ENST00000353258 IQGAP2Q13576 1575 aa23.26■■□□□ 1.31
GDE1-201ENST00000353258 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.25■■□□□ 1.31
GDE1-201ENST00000353258 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.25■■□□□ 1.31
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GDE1-201ENST00000353258 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.22■■□□□ 1.31
GDE1-201ENST00000353258 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.22■■□□□ 1.31
GDE1-201ENST00000353258 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.22■■□□□ 1.31
GDE1-201ENST00000353258 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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GDE1-201ENST00000353258 NBR1Q14596 966 aa23.19■■□□□ 1.3
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GDE1-201ENST00000353258 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
GDE1-201ENST00000353258 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.16■■□□□ 1.3
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GDE1-201ENST00000353258 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.15■■□□□ 1.3
GDE1-201ENST00000353258 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GDE1-201ENST00000353258 NAIPQ13075 1403 aa23.14■■□□□ 1.29
GDE1-201ENST00000353258 WDR62O43379 1518 aa23.11■■□□□ 1.29
GDE1-201ENST00000353258 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
GDE1-201ENST00000353258 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.11■■□□□ 1.29
GDE1-201ENST00000353258 ERCC6Q03468 1493 aa23.1■■□□□ 1.29
GDE1-201ENST00000353258 UACAQ9BZF9 1416 aa23.09■■□□□ 1.29
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