RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343017.11

SNX18-202, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

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Gene SNX18, Length 3,140 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-202ENST00000343017 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.47■■□□□ 1.03
SNX18-202ENST00000343017 MAPKBP1O60336 1514 aa21.45■■□□□ 1.02
SNX18-202ENST00000343017 ANP32CO43423 234 aa21.44■■□□□ 1.02
SNX18-202ENST00000343017 CUX2O14529 1486 aa21.4■■□□□ 1.02
SNX18-202ENST00000343017 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SNX18-202ENST00000343017 CCER2I3L3R5 266 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX18-202ENST00000343017 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX18-202ENST00000343017 CFTRP13569 1480 aa21.37■■□□□ 1.01
SNX18-202ENST00000343017 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.36■■□□□ 1.01
SNX18-202ENST00000343017 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
SNX18-202ENST00000343017 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
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SNX18-202ENST00000343017 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
SNX18-202ENST00000343017 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.29■■□□□ 1
SNX18-202ENST00000343017 NESP48681 1621 aa21.28■■□□□ 1
SNX18-202ENST00000343017 TOP2BQ02880 1626 aa21.28■■□□□ 1
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SNX18-202ENST00000343017 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
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SNX18-202ENST00000343017 KIF27Q86VH2 1401 aa21.19■□□□□ 0.98
SNX18-202ENST00000343017 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.18■□□□□ 0.98
SNX18-202ENST00000343017 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.18■□□□□ 0.98
SNX18-202ENST00000343017 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SNX18-202ENST00000343017 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.16■□□□□ 0.98
SNX18-202ENST00000343017 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.15■□□□□ 0.98
SNX18-202ENST00000343017 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
SNX18-202ENST00000343017 CCDC184Q52MB2 194 aa21.11■□□□□ 0.97
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SNX18-202ENST00000343017 P3H3Q8IVL6 736 aa21.11■□□□□ 0.97
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SNX18-202ENST00000343017 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.09■□□□□ 0.97
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SNX18-202ENST00000343017 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.06■□□□□ 0.96
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SNX18-202ENST00000343017 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21■□□□□ 0.95
SNX18-202ENST00000343017 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.98■□□□□ 0.95
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SNX18-202ENST00000343017 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SNX18-202ENST00000343017 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.92■□□□□ 0.94
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SNX18-202ENST00000343017 TOPBP1Q92547 1522 aa20.9■□□□□ 0.94
SNX18-202ENST00000343017 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
SNX18-202ENST00000343017 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SNX18-202ENST00000343017 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
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SNX18-202ENST00000343017 MAP3K1Q13233 1512 aa20.81■□□□□ 0.92
SNX18-202ENST00000343017 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
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SNX18-202ENST00000343017 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.79■□□□□ 0.92
SNX18-202ENST00000343017 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.79■□□□□ 0.92
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SNX18-202ENST00000343017 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
SNX18-202ENST00000343017 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.78■□□□□ 0.92
SNX18-202ENST00000343017 PTPRKQ15262 1439 aa20.78■□□□□ 0.92
SNX18-202ENST00000343017 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
SNX18-202ENST00000343017 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
SNX18-202ENST00000343017 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.76■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 AKNAQ7Z591 1439 aa20.76■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.75■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.74■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.73■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 UACAQ9BZF9 1416 aa20.72■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.71■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.71■□□□□ 0.91
SNX18-202ENST00000343017 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.7■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 ARID3CA6NKF2 412 aa20.7■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 FOXD1Q16676 465 aa20.69■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.69■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.68■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.65■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.65■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 HFM1A2PYH4 1435 aa20.64■□□□□ 0.9
SNX18-202ENST00000343017 NAIPQ13075 1403 aa20.64■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 CCDC7Q96M83 1385 aa20.64■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.64■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.63■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 FBLN2P98095 1184 aa20.62■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 NCOA2Q15596 1464 aa20.62■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.62■□□□□ 0.89
SNX18-202ENST00000343017 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
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