RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.64□□□□□ -0.71
PTPRR-202ENST00000342084 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
PTPRR-202ENST00000342084 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.63□□□□□ -0.71
PTPRR-202ENST00000342084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.62□□□□□ -0.71
PTPRR-202ENST00000342084 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRR-202ENST00000342084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRR-202ENST00000342084 NESP48681 1621 aa10.61□□□□□ -0.71
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.6□□□□□ -0.71
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PTPRR-202ENST00000342084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRR-202ENST00000342084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRR-202ENST00000342084 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
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PTPRR-202ENST00000342084 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.47□□□□□ -0.73
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PTPRR-202ENST00000342084 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.47□□□□□ -0.73
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PTPRR-202ENST00000342084 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRR-202ENST00000342084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRR-202ENST00000342084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRR-202ENST00000342084 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRR-202ENST00000342084 PTPRKQ15262 1439 aa10.43□□□□□ -0.74
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PTPRR-202ENST00000342084 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.42□□□□□ -0.74
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PTPRR-202ENST00000342084 FMN1Q68DA7 1419 aa10.41□□□□□ -0.74
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PTPRR-202ENST00000342084 NCOA2Q15596 1464 aa10.38□□□□□ -0.75
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PTPRR-202ENST00000342084 HFM1A2PYH4 1435 aa10.34□□□□□ -0.75
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PTPRR-202ENST00000342084 UACAQ9BZF9 1416 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRR-202ENST00000342084 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRR-202ENST00000342084 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.32□□□□□ -0.76
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PTPRR-202ENST00000342084 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.31□□□□□ -0.76
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PTPRR-202ENST00000342084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
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PTPRR-202ENST00000342084 HECW1Q76N89 1606 aa10.26□□□□□ -0.77
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PTPRR-202ENST00000342084 CCER2I3L3R5 266 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-202ENST00000342084 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-202ENST00000342084 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRR-202ENST00000342084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRR-202ENST00000342084 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRR-202ENST00000342084 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRR-202ENST00000342084 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PTPRR-202ENST00000342084 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRR-202ENST00000342084 NEFLP07196 543 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRR-202ENST00000342084 ERCC6Q03468 1493 aa10.18□□□□□ -0.78
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