RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336564.4

ZNF576-201, Transcript of zinc finger protein 576, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF576, Length 2,566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF576-201ENST00000336564 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
ZNF576-201ENST00000336564 BCANQ96GW7 911 aa20.71■□□□□ 0.91
ZNF576-201ENST00000336564 NESP48681 1621 aa20.69■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 TIAM1Q13009 1591 aa20.66■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.66■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 IGF1RP08069 1367 aa20.66■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.66■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 WDR97A6NE52 1622 aa20.65■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.65■□□□□ 0.9
ZNF576-201ENST00000336564 P3H3Q8IVL6 736 aa20.64■□□□□ 0.89
ZNF576-201ENST00000336564 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ZNF576-201ENST00000336564 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.61■□□□□ 0.89
ZNF576-201ENST00000336564 FKBP8Q14318 412 aa20.6■□□□□ 0.89
ZNF576-201ENST00000336564 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.59■□□□□ 0.89
ZNF576-201ENST00000336564 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.58■□□□□ 0.89
ZNF576-201ENST00000336564 MAP3K1Q13233 1512 aa20.54■□□□□ 0.88
ZNF576-201ENST00000336564 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ZNF576-201ENST00000336564 TRIM52Q96A61 297 aa20.52■□□□□ 0.88
ZNF576-201ENST00000336564 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF576-201ENST00000336564 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.49■□□□□ 0.87
ZNF576-201ENST00000336564 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
ZNF576-201ENST00000336564 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.47■□□□□ 0.87
ZNF576-201ENST00000336564 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF576-201ENST00000336564 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.46■□□□□ 0.87
ZNF576-201ENST00000336564 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.44■□□□□ 0.86
ZNF576-201ENST00000336564 ANP32CO43423 234 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF576-201ENST00000336564 TOPBP1Q92547 1522 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF576-201ENST00000336564 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.42■□□□□ 0.86
ZNF576-201ENST00000336564 NEFLP07196 543 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF576-201ENST00000336564 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.41■□□□□ 0.86
ZNF576-201ENST00000336564 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ZNF576-201ENST00000336564 CCER2I3L3R5 266 aa20.38■□□□□ 0.85
ZNF576-201ENST00000336564 TONSLQ96HA7 1378 aa20.34■□□□□ 0.85
ZNF576-201ENST00000336564 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ZNF576-201ENST00000336564 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.31■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.31■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.3■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 ERCC6Q03468 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.29■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.28■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 PTPRKQ15262 1439 aa20.27■□□□□ 0.84
ZNF576-201ENST00000336564 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
ZNF576-201ENST00000336564 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF576-201ENST00000336564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.23■□□□□ 0.83
ZNF576-201ENST00000336564 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ZNF576-201ENST00000336564 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
ZNF576-201ENST00000336564 UACAQ9BZF9 1416 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF576-201ENST00000336564 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF576-201ENST00000336564 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 HFM1A2PYH4 1435 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 WDR62O43379 1518 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 FMN1Q68DA7 1419 aa20.17■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 NAIPQ13075 1403 aa20.16■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.15■□□□□ 0.82
ZNF576-201ENST00000336564 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 NCOA2Q15596 1464 aa20.12■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 MSH5O43196 834 aa20.11■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 CUL7Q14999 1698 aa20.09■□□□□ 0.81
ZNF576-201ENST00000336564 CCDC184Q52MB2 194 aa20.07■□□□□ 0.8
ZNF576-201ENST00000336564 BCL11AQ9H165 835 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF576-201ENST00000336564 IFT140Q96RY7 1462 aa20.06■□□□□ 0.8
ZNF576-201ENST00000336564 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ZNF576-201ENST00000336564 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.05■□□□□ 0.8
ZNF576-201ENST00000336564 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.04■□□□□ 0.8
ZNF576-201ENST00000336564 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 GRIN2BQ13224 1484 aa20.01■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 FOXD1Q16676 465 aa20.01■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 SAMD9Q5K651 1589 aa19.99■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.98■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.97■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 ARID3CA6NKF2 412 aa19.96■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.96■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.96■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 KDM6BO15054 1643 aa19.96■□□□□ 0.79
ZNF576-201ENST00000336564 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.95■□□□□ 0.78
ZNF576-201ENST00000336564 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.94■□□□□ 0.78
ZNF576-201ENST00000336564 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.93■□□□□ 0.78
ZNF576-201ENST00000336564 PBRM1Q86U86 1689 aa19.93■□□□□ 0.78
ZNF576-201ENST00000336564 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
ZNF576-201ENST00000336564 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.92■□□□□ 0.78
ZNF576-201ENST00000336564 MRS2Q9HD23 443 aa19.91■□□□□ 0.78
ZNF576-201ENST00000336564 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms