RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.95■■■□□ 2.87
HOXD1-201ENST00000331462 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.89■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 MAPKBP1O60336 1514 aa32.89■■■□□ 2.86
HOXD1-201ENST00000331462 CUL7Q14999 1698 aa32.87■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 TOPBP1Q92547 1522 aa32.85■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 PHLDB1Q86UU1 1377 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD1-201ENST00000331462 SETD5Q9C0A6 1442 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXD1-201ENST00000331462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.76■■■□□ 2.84
HOXD1-201ENST00000331462 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.76■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.73■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 ITGAEP38570 1179 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 WDR97A6NE52 1622 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD1-201ENST00000331462 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD1-201ENST00000331462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD1-201ENST00000331462 NESP48681 1621 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD1-201ENST00000331462 FMN1Q68DA7 1419 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD1-201ENST00000331462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 SAMD9Q5K651 1589 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 P3H3Q8IVL6 736 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXD1-201ENST00000331462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
HOXD1-201ENST00000331462 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXD1-201ENST00000331462 GRIN2BQ13224 1484 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.37■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 HFM1A2PYH4 1435 aa32.33■■■□□ 2.77
HOXD1-201ENST00000331462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.29■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.28■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
HOXD1-201ENST00000331462 NCOA2Q15596 1464 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 UACAQ9BZF9 1416 aa32.25■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF11O15085 1522 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRKQ15262 1439 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXD1-201ENST00000331462 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXD1-201ENST00000331462 NAIPQ13075 1403 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXD1-201ENST00000331462 MYT1Q01538 1121 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 HECW1Q76N89 1606 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 TONSLQ96HA7 1378 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 PBRM1Q86U86 1689 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXD1-201ENST00000331462 KCNH8Q96L42 1107 aa32.07■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 AKNAQ7Z591 1439 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 ADAMTS12P58397 1594 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 IQGAP2Q13576 1575 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 CCER2I3L3R5 266 aa32.01■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.01■■■□□ 2.72
HOXD1-201ENST00000331462 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.94■■■□□ 2.7
HOXD1-201ENST00000331462 MIA2Q96PC5 1412 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD1-201ENST00000331462 WDR62O43379 1518 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXD1-201ENST00000331462 ANP32CO43423 234 aa31.87■■■□□ 2.69
HOXD1-201ENST00000331462 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
HOXD1-201ENST00000331462 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.85■■■□□ 2.69
HOXD1-201ENST00000331462 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
HOXD1-201ENST00000331462 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
HOXD1-201ENST00000331462 KDM6BO15054 1643 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXD1-201ENST00000331462 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD1-201ENST00000331462 IFT140Q96RY7 1462 aa31.7■■■□□ 2.67
HOXD1-201ENST00000331462 ROCK1Q13464 1354 aa31.7■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0556O60303 1618 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 ERCC6Q03468 1493 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 DISP1Q96F81 1524 aa31.64■■■□□ 2.66
HOXD1-201ENST00000331462 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 DAPK1P53355 1430 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 FKBP8Q14318 412 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM52Q96A61 297 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC5O15440 1437 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.54■■■□□ 2.64
HOXD1-201ENST00000331462 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms