RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331148.5

CLSTN3-202, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLSTN3, Length 2,288 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-202ENST00000331148 WDR62O43379 1518 aa26.44■■□□□ 1.82
CLSTN3-202ENST00000331148 CLIP1P30622 1438 aa26.43■■□□□ 1.82
CLSTN3-202ENST00000331148 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CLSTN3-202ENST00000331148 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CLSTN3-202ENST00000331148 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.39■■□□□ 1.82
CLSTN3-202ENST00000331148 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.38■■□□□ 1.81
CLSTN3-202ENST00000331148 CUL7Q14999 1698 aa26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3-202ENST00000331148 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.37■■□□□ 1.81
CLSTN3-202ENST00000331148 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.35■■□□□ 1.81
CLSTN3-202ENST00000331148 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CLSTN3-202ENST00000331148 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.34■■□□□ 1.81
CLSTN3-202ENST00000331148 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CLSTN3-202ENST00000331148 IFT140Q96RY7 1462 aa26.3■■□□□ 1.8
CLSTN3-202ENST00000331148 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CLSTN3-202ENST00000331148 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
CLSTN3-202ENST00000331148 APLP2Q06481 763 aa26.21■■□□□ 1.79
CLSTN3-202ENST00000331148 PBRM1Q86U86 1689 aa26.18■■□□□ 1.78
CLSTN3-202ENST00000331148 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CLSTN3-202ENST00000331148 GRIN2BQ13224 1484 aa26.14■■□□□ 1.78
CLSTN3-202ENST00000331148 ARAP1Q96P48 1450 aa26.13■■□□□ 1.77
CLSTN3-202ENST00000331148 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3-202ENST00000331148 BCL11AQ9H165 835 aa26.12■■□□□ 1.77
CLSTN3-202ENST00000331148 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.09■■□□□ 1.77
CLSTN3-202ENST00000331148 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.08■■□□□ 1.77
CLSTN3-202ENST00000331148 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CLSTN3-202ENST00000331148 ADAMTS12P58397 1594 aa26.04■■□□□ 1.76
CLSTN3-202ENST00000331148 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.95■■□□□ 1.75
CLSTN3-202ENST00000331148 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.95■■□□□ 1.75
CLSTN3-202ENST00000331148 KCNH8Q96L42 1107 aa25.9■■□□□ 1.74
CLSTN3-202ENST00000331148 P3H3Q8IVL6 736 aa25.9■■□□□ 1.74
CLSTN3-202ENST00000331148 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CLSTN3-202ENST00000331148 BCANQ96GW7 911 aa25.89■■□□□ 1.74
CLSTN3-202ENST00000331148 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CLSTN3-202ENST00000331148 FKBP8Q14318 412 aa25.83■■□□□ 1.73
CLSTN3-202ENST00000331148 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.83■■□□□ 1.73
CLSTN3-202ENST00000331148 GRIN2AQ12879 1464 aa25.82■■□□□ 1.72
CLSTN3-202ENST00000331148 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3-202ENST00000331148 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CLSTN3-202ENST00000331148 SYNJ2O15056 1496 aa25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3-202ENST00000331148 SAMD9Q5K651 1589 aa25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3-202ENST00000331148 IQGAP2Q13576 1575 aa25.8■■□□□ 1.72
CLSTN3-202ENST00000331148 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
CLSTN3-202ENST00000331148 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3-202ENST00000331148 FBLN2P98095 1184 aa25.74■■□□□ 1.71
CLSTN3-202ENST00000331148 FMN1Q68DA7 1419 aa25.73■■□□□ 1.71
CLSTN3-202ENST00000331148 MAP3K1Q13233 1512 aa25.72■■□□□ 1.71
CLSTN3-202ENST00000331148 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.7■■□□□ 1.71
CLSTN3-202ENST00000331148 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 MAPKBP1O60336 1514 aa25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.68■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 TIAM1Q13009 1591 aa25.67■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 NEFLP07196 543 aa25.66■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 CEP170Q5SW79 1584 aa25.64■■□□□ 1.7
CLSTN3-202ENST00000331148 NUP160Q12769 1436 aa25.62■■□□□ 1.69
CLSTN3-202ENST00000331148 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.61■■□□□ 1.69
CLSTN3-202ENST00000331148 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3-202ENST00000331148 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CLSTN3-202ENST00000331148 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.56■■□□□ 1.68
CLSTN3-202ENST00000331148 DISP1Q96F81 1524 aa25.55■■□□□ 1.68
CLSTN3-202ENST00000331148 ITGAEP38570 1179 aa25.54■■□□□ 1.68
CLSTN3-202ENST00000331148 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3-202ENST00000331148 KIAA0556O60303 1618 aa25.53■■□□□ 1.68
CLSTN3-202ENST00000331148 JPH4Q96JJ6 628 aa25.51■■□□□ 1.67
CLSTN3-202ENST00000331148 MSH5O43196 834 aa25.5■■□□□ 1.67
CLSTN3-202ENST00000331148 CCER2I3L3R5 266 aa25.49■■□□□ 1.67
CLSTN3-202ENST00000331148 CHD1O14646 1710 aa25.47■■□□□ 1.67
CLSTN3-202ENST00000331148 TRIM52Q96A61 297 aa25.46■■□□□ 1.67
CLSTN3-202ENST00000331148 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.45■■□□□ 1.66
CLSTN3-202ENST00000331148 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.44■■□□□ 1.66
CLSTN3-202ENST00000331148 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.43■■□□□ 1.66
CLSTN3-202ENST00000331148 HECW1Q76N89 1606 aa25.42■■□□□ 1.66
CLSTN3-202ENST00000331148 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3-202ENST00000331148 ANP32CO43423 234 aa25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3-202ENST00000331148 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.39■■□□□ 1.66
CLSTN3-202ENST00000331148 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.39■■□□□ 1.65
CLSTN3-202ENST00000331148 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.38■■□□□ 1.65
CLSTN3-202ENST00000331148 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.35■■□□□ 1.65
CLSTN3-202ENST00000331148 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3-202ENST00000331148 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CLSTN3-202ENST00000331148 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.31■■□□□ 1.64
CLSTN3-202ENST00000331148 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CLSTN3-202ENST00000331148 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CLSTN3-202ENST00000331148 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.28■■□□□ 1.64
CLSTN3-202ENST00000331148 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CLSTN3-202ENST00000331148 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 ARID3CA6NKF2 412 aa25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.25■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.23■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 SHROOM2Q13796 1616 aa25.23■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 NCOA2Q15596 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
CLSTN3-202ENST00000331148 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3-202ENST00000331148 PTPRGP23470 1445 aa25.17■■□□□ 1.62
CLSTN3-202ENST00000331148 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.16■■□□□ 1.62
CLSTN3-202ENST00000331148 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms