RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324266.9

TRAPPC12-201, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC12, Length 2,508 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-201ENST00000324266 TOPBP1Q92547 1522 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12-201ENST00000324266 ITGAEP38570 1179 aa26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC12-201ENST00000324266 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC12-201ENST00000324266 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC12-201ENST00000324266 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC12-201ENST00000324266 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12-201ENST00000324266 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC12-201ENST00000324266 ERCC6Q03468 1493 aa26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC12-201ENST00000324266 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC12-201ENST00000324266 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC12-201ENST00000324266 CUX2O14529 1486 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12-201ENST00000324266 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC12-201ENST00000324266 IGF1RP08069 1367 aa25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC12-201ENST00000324266 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC12-201ENST00000324266 WDR62O43379 1518 aa25.9■■□□□ 1.74
TRAPPC12-201ENST00000324266 TIAM1Q13009 1591 aa25.89■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 MAPKBP1O60336 1514 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 KCNH8Q96L42 1107 aa25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 P3H3Q8IVL6 736 aa25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC12-201ENST00000324266 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 MAP3K1Q13233 1512 aa25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 WDR97A6NE52 1622 aa25.76■■□□□ 1.72
TRAPPC12-201ENST00000324266 IFT140Q96RY7 1462 aa25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.68■■□□□ 1.76e-6■■■■□ 25.1
TRAPPC12-201ENST00000324266 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.64■■□□□ 1.7
TRAPPC12-201ENST00000324266 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12-201ENST00000324266 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
TRAPPC12-201ENST00000324266 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
TRAPPC12-201ENST00000324266 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TRAPPC12-201ENST00000324266 BCANQ96GW7 911 aa25.52■■□□□ 1.68
TRAPPC12-201ENST00000324266 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 CUL7Q14999 1698 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 PBRM1Q86U86 1689 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 GRIN2BQ13224 1484 aa25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 MSH5O43196 834 aa25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC12-201ENST00000324266 FKBP8Q14318 412 aa25.43■■□□□ 1.66
TRAPPC12-201ENST00000324266 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.42■■□□□ 1.66
TRAPPC12-201ENST00000324266 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.41■■□□□ 1.66
TRAPPC12-201ENST00000324266 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC12-201ENST00000324266 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.663e-6■■■■□ 26.4
TRAPPC12-201ENST00000324266 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 TRIM52Q96A61 297 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 PTPRKQ15262 1439 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 ANP32CO43423 234 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 TONSLQ96HA7 1378 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 ADAMTS12P58397 1594 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 FMN1Q68DA7 1419 aa25.34■■□□□ 1.65
TRAPPC12-201ENST00000324266 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12-201ENST00000324266 CCER2I3L3R5 266 aa25.31■■□□□ 1.64
TRAPPC12-201ENST00000324266 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC12-201ENST00000324266 FBLN2P98095 1184 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC12-201ENST00000324266 HFM1A2PYH4 1435 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC12-201ENST00000324266 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 UACAQ9BZF9 1416 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 NCOA2Q15596 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 NAIPQ13075 1403 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 NEFLP07196 543 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC12-201ENST00000324266 SYNJ2O15056 1496 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC12-201ENST00000324266 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12-201ENST00000324266 GRIN2AQ12879 1464 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12-201ENST00000324266 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC12-201ENST00000324266 SAMD9Q5K651 1589 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC12-201ENST00000324266 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12-201ENST00000324266 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC12-201ENST00000324266 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC12-201ENST00000324266 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12-201ENST00000324266 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC12-201ENST00000324266 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12-201ENST00000324266 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC12-201ENST00000324266 IQGAP2Q13576 1575 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12-201ENST00000324266 CEP170Q5SW79 1584 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC12-201ENST00000324266 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.04■■□□□ 1.6
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